More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2433 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  100 
 
 		 185 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  68.85 
 
 		 184 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  65.24 
 
 		 166 aa  223  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  66.04 
 
 		 161 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  62.26 
 
 		 162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  61.64 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  58.54 
 
 		 180 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  59.01 
 
 		 162 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  59.12 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  57.93 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  58.39 
 
 		 162 aa  191  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  54.55 
 
 		 181 aa  190  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  60 
 
 		 168 aa  187  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  53.05 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  57.67 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  50 
 
 		 181 aa  181  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  57.93 
 
 		 182 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  50.61 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  52.44 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  47.57 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  53.94 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  54.6 
 
 		 163 aa  170  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  54.72 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  52.17 
 
 		 162 aa  169  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  46.93 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  46.49 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  46.15 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  50 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  42.93 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  52.47 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  46.51 
 
 		 190 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  43.26 
 
 		 213 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  42.03 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  44.77 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  43.39 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  45.96 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  50 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  46 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  45.18 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  41.77 
 
 		 162 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  49.69 
 
 		 177 aa  124  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  43.42 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  42.77 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  43.33 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  39.43 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  43.01 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  43.01 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  43.01 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  42.46 
 
 		 197 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  41.62 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.71 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  43.33 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.82 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.82 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  43.04 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  42.35 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  40.37 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  40.12 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  42.31 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  40.14 
 
 		 172 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  41.11 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  36.76 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  39.77 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  42.51 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  39.86 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  39.22 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  44.17 
 
 		 200 aa  104  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  37.93 
 
 		 153 aa  104  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.22 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  41.22 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  38.89 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  40.72 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  37.25 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  36.53 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  44.44 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  38.41 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  38.99 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  38.36 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  37.29 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  38.36 
 
 		 164 aa  101  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  37.93 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  37.2 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  38.89 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.73 
 
 		 164 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  34.23 
 
 		 162 aa  99.4  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  42.48 
 
 		 177 aa  99.4  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  38.04 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  41.61 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  37.74 
 
 		 173 aa  99  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  29.27 
 
 		 169 aa  98.2  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  31.65 
 
 		 169 aa  98.2  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  40.14 
 
 		 155 aa  97.8  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  39.87 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  37.42 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  35.39 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  42.14 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  32.56 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  32.56 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  32.56 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  37.24 
 
 		 152 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>