43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2429 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2429  streptomycin 6-kinase  100 
 
 
306 aa  618  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0298  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  51.97 
 
 
309 aa  289  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.449073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1604  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.27 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0859815  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0261  6-kinase  26.57 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1665  hydroxyurea phosphotransferase  25.54 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2188  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  26.12 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2285  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0514  aminoglycoside phosphotransferase family protein  24.82 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5378  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.88 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7130  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  25.27 
 
 
267 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3440  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.01 
 
 
310 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.0646314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1892  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.82 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.565098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4253  6-kinase  27.39 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1673  streptomycin resistance protein  38.21 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3746  kinase  28.04 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2227  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  26.3 
 
 
284 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2219  6-kinase  26.35 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000195606  decreased coverage  0.000000830578 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5323  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.02 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0213  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.96 
 
 
264 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53187  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4780  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  35.42 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.35446  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35670  streptomycin 6-kinase  24.91 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1244  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  26.46 
 
 
272 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761762  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1923  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  36.45 
 
 
270 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.970789  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3891  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.51 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.571465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3719  streptomycin 3''-kinase  25.1 
 
 
266 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2714  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  25.58 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2457  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.61 
 
 
271 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0327  aminoglycoside phosphotransferase  28.35 
 
 
274 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3035  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  23.85 
 
 
264 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3432  streptomycin 3''-kinase  28.95 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30370  streptomycin 6-kinase  25.52 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40450  streptomycin 3''-phosphotransferase  24.63 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2501  3''-kinase  43.33 
 
 
277 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0803  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.4 
 
 
285 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6740  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.87 
 
 
195 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.515354 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4830  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.31 
 
 
279 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5439  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.31 
 
 
279 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5423  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.31 
 
 
279 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4430  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  26.46 
 
 
265 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796967  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2726  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.66 
 
 
266 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167772  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2987  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  25.1 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0510787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0248  putative streptomycin phosphotransferase  32.63 
 
 
120 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2795  3''-kinase  25.79 
 
 
265 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.342668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>