More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2403 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  100 
 
 
512 aa  1039    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  60.21 
 
 
534 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  51.53 
 
 
512 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  47.97 
 
 
518 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  46.35 
 
 
536 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  46.35 
 
 
535 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  47.17 
 
 
548 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  44.8 
 
 
515 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  45.73 
 
 
514 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  45.21 
 
 
555 aa  350  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  45.79 
 
 
512 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  42.89 
 
 
509 aa  342  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  42.07 
 
 
512 aa  322  9.000000000000001e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  45.82 
 
 
481 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  44.7 
 
 
506 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  43.04 
 
 
502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  41.86 
 
 
500 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  40.63 
 
 
501 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  42.86 
 
 
501 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  42.86 
 
 
501 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  39.64 
 
 
513 aa  296  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  45.78 
 
 
524 aa  290  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  42.48 
 
 
510 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  37.32 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  43.04 
 
 
512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  36.63 
 
 
488 aa  247  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  36.12 
 
 
479 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  35.9 
 
 
479 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  35.9 
 
 
479 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  36.55 
 
 
488 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  34.38 
 
 
502 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  49.79 
 
 
518 aa  223  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  49.79 
 
 
519 aa  223  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  50.45 
 
 
502 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  39.16 
 
 
533 aa  213  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  48.64 
 
 
312 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  44.26 
 
 
1147 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  42.13 
 
 
1077 aa  163  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  43.67 
 
 
1131 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  40.78 
 
 
947 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  38.98 
 
 
437 aa  140  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  39.47 
 
 
313 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  39.51 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  32.57 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.07 
 
 
391 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  29.8 
 
 
466 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  30 
 
 
466 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  29.91 
 
 
466 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  29.53 
 
 
466 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  29.53 
 
 
466 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  28.41 
 
 
466 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  29.91 
 
 
466 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  29.53 
 
 
466 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  29.53 
 
 
466 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  29.76 
 
 
466 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  30.32 
 
 
465 aa  103  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  27.37 
 
 
584 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  25.25 
 
 
555 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  31.49 
 
 
450 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  32.34 
 
 
436 aa  94.4  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  29.24 
 
 
454 aa  94  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  29.66 
 
 
456 aa  87.4  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  27.27 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  29.2 
 
 
571 aa  84.7  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  25.26 
 
 
457 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  29.97 
 
 
454 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  26.89 
 
 
440 aa  79.7  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  41.84 
 
 
539 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  26.78 
 
 
495 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  29.11 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  32.82 
 
 
578 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  40.57 
 
 
552 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  31.12 
 
 
467 aa  77  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.47 
 
 
497 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  31.84 
 
 
544 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  27.06 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  46.91 
 
 
525 aa  74.7  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  27.51 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  29.58 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  25.46 
 
 
944 aa  74.3  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  33.74 
 
 
481 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  28.94 
 
 
468 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  34.62 
 
 
438 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  29.94 
 
 
454 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  30.3 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  27.07 
 
 
598 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  25.61 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  29.14 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  30.3 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  28.32 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  31.46 
 
 
625 aa  70.5  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  29.87 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  27.78 
 
 
447 aa  70.1  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  39.22 
 
 
333 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  29.06 
 
 
479 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  27.18 
 
 
468 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  32 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  29.87 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  31.77 
 
 
727 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  34.62 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>