126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2383 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 
262 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  55.74 
 
 
268 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  39.83 
 
 
556 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  40.66 
 
 
521 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  37.26 
 
 
312 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  34.38 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  37.44 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  36.36 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  36.5 
 
 
192 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  33.48 
 
 
323 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  30.48 
 
 
298 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.94 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  31.17 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  30.61 
 
 
238 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  28.92 
 
 
266 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  30.29 
 
 
238 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  29.64 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  39.62 
 
 
243 aa  99.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  30 
 
 
353 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  30.77 
 
 
412 aa  97.1  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  32.1 
 
 
368 aa  94  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  30.9 
 
 
242 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  30.53 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  27.73 
 
 
229 aa  92  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  29.86 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  35.23 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  29.12 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  27.16 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  32.89 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  32.89 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  32.26 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  34.62 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  25.63 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  31.51 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  32.69 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  26.2 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  26.2 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 
210 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 
210 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 
210 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 
210 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 
210 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  36.19 
 
 
222 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  27.31 
 
 
316 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  30.07 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  27.6 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  25.64 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.76 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  25.82 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  40.38 
 
 
218 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  31.21 
 
 
266 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  29.68 
 
 
291 aa  58.9  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  39.62 
 
 
298 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  37.25 
 
 
195 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  32.45 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  32.61 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  25.76 
 
 
384 aa  57.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  28.89 
 
 
305 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  30 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  27.38 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  24.76 
 
 
200 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  30.99 
 
 
316 aa  56.2  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.33 
 
 
206 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  36.63 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  33.01 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  33.33 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  25.45 
 
 
206 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.57 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  26.71 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  30 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  29.68 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  30.14 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  25.47 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  26.03 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  35.58 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  33.77 
 
 
205 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  29.03 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  27.78 
 
 
294 aa  52.8  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  29.19 
 
 
344 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.43 
 
 
206 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.85 
 
 
206 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  22.89 
 
 
187 aa  52  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  28.26 
 
 
260 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  28.86 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  37.86 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  28.47 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  29.13 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.15 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  28.86 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  22.89 
 
 
187 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  34.38 
 
 
302 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.36 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.86 
 
 
206 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  30.3 
 
 
233 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  29.86 
 
 
377 aa  50.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.86 
 
 
206 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  26.94 
 
 
213 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  28.37 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>