More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2299 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  78.7 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  65.62 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  59.38 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  56.25 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 		 119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  53.15 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  60.47 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.37 
 
 		 111 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  60.23 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  55.56 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  59.34 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  61.9 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  53.93 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  50.54 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  48.65 
 
 		 168 aa  94  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  39.09 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  41.94 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  43.84 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 227 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  28.7 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  37.21 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  45.33 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  45.33 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 437 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  43.28 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  42.68 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  37.25 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  37.25 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  40.54 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 399 aa  53.9  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  35.4 
 
 		 222 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  47.62 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>