211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2288 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  687    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  58.25 
 
 		 665 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  54.65 
 
 		 899 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  57.98 
 
 		 698 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  51.27 
 
 		 639 aa  322  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  57.69 
 
 		 619 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  53.33 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  46.94 
 
 		 343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  51.68 
 
 		 418 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  49.01 
 
 		 495 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  46.3 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  46.3 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  46.3 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  48.34 
 
 		 405 aa  255  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  48.72 
 
 		 771 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  44.15 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  46.13 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  48.78 
 
 		 478 aa  239  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  48.6 
 
 		 759 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  37.84 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  37.5 
 
 		 463 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  36.24 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  35.91 
 
 		 552 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  37.42 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  35.69 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  37.41 
 
 		 475 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  37.41 
 
 		 475 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  37.41 
 
 		 475 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  33.55 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  34.33 
 
 		 587 aa  166  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  35.74 
 
 		 425 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  36.79 
 
 		 666 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  36.16 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  36.16 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  36.16 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  34.38 
 
 		 1132 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  31.97 
 
 		 390 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  34.11 
 
 		 534 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  34.86 
 
 		 926 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  36.44 
 
 		 1519 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  31.17 
 
 		 811 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  33.23 
 
 		 390 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.78 
 
 		 532 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  31.61 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  34.28 
 
 		 1160 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  35.29 
 
 		 544 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  32.37 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  34.9 
 
 		 968 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.1 
 
 		 542 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  29.6 
 
 		 586 aa  99.8  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  30.2 
 
 		 533 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  29.9 
 
 		 439 aa  92.8  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  28.39 
 
 		 617 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  27.76 
 
 		 579 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.87 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  27.73 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  27.95 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  27.95 
 
 		 485 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  32.61 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  31.16 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.73 
 
 		 659 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  26.9 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  24 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.58 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.49 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04100  hypothetical protein  30 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0820213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.5 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.46 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.62 
 
 		 262 aa  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.54 
 
 		 263 aa  49.7  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.24 
 
 		 264 aa  49.3  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.143789 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.28 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.28 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.28 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.5 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.4 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  27.03 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  25.46 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  25.23 
 
 		 544 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  25.46 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  25.46 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  31.65 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.56 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  27.73 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  25.69 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.91 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  37.5 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  26.88 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  25.83 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.01 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.34 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  28.63 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.48 
 
 		 259 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1726  hypothetical protein  30.08 
 
 		 550 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0145734  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>