More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2262 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  100 
 
 		 388 aa  775    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  60.65 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.43 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  48.11 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  44.1 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  50.71 
 
 		 204 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  55.86 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  54.37 
 
 		 535 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  48.21 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  50 
 
 		 524 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  47.15 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  50.48 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  40.97 
 
 		 475 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  40.97 
 
 		 475 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  40.97 
 
 		 475 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.32 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  45.07 
 
 		 225 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  47.22 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  40.14 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  45.52 
 
 		 256 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  44.78 
 
 		 256 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  44.78 
 
 		 256 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  42.02 
 
 		 1048 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  36.42 
 
 		 472 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  40.91 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  41.62 
 
 		 467 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  45.52 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  45.52 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  45.52 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.49 
 
 		 556 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  44.76 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 228 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.28 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.13 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 469 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  43.41 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  44.78 
 
 		 256 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  44.78 
 
 		 256 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 469 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 265 aa  99.8  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  41.45 
 
 		 469 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 221 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.04 
 
 		 531 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.07 
 
 		 235 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 384 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  40.65 
 
 		 241 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 241 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  40.6 
 
 		 478 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  40.3 
 
 		 479 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  42.54 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  30.77 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  44.86 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  44.66 
 
 		 257 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  45.87 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  43.28 
 
 		 248 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  43.1 
 
 		 459 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  41.43 
 
 		 472 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 295 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  39.73 
 
 		 174 aa  97.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  46.36 
 
 		 463 aa  97.1  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 230 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 162 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  44.04 
 
 		 197 aa  96.3  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.48 
 
 		 332 aa  96.7  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  41.58 
 
 		 502 aa  96.3  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 392 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.37 
 
 		 329 aa  96.3  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 164 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 293 aa  96.3  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 337 aa  96.3  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  34.13 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  46.6 
 
 		 216 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  44.35 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.16 
 
 		 475 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  38.05 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  45.63 
 
 		 491 aa  94.4  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 495 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 422 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  38.74 
 
 		 333 aa  93.6  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 319 aa  93.6  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  41.01 
 
 		 362 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 388 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  38.76 
 
 		 239 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  39.01 
 
 		 347 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 278 aa  92.8  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  48.94 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  40.91 
 
 		 487 aa  92.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>