163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2213 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  292  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  59.7 
 
 
147 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 
137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 
145 aa  134  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 
143 aa  130  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  48.91 
 
 
167 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  46.76 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
129 aa  107  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 
132 aa  107  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  46.1 
 
 
148 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  46.38 
 
 
148 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  43.7 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  38.85 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  38.03 
 
 
183 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 
181 aa  84.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  39.1 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
166 aa  82  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  34.97 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  38.1 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  37.69 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  32.48 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  32.61 
 
 
138 aa  67  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  35.76 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  32.28 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  32.8 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  32.28 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  31.65 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  32.35 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  39.45 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  33.8 
 
 
173 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  29.55 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  26.45 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  43.27 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  27.05 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  26.61 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  26.61 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  26.61 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  30.77 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  29.41 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  29.73 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
140 aa  52  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  31.67 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
158 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  24.17 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
136 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  25.47 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
162 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.39 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  24.53 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.51 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>