More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2170 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  100 
 
 
134 aa  273  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  74.8 
 
 
132 aa  204  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  72.73 
 
 
139 aa  199  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2452  iojap-like protein  70.9 
 
 
134 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.344945  normal  0.138235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7260  hypothetical protein  78.33 
 
 
135 aa  174  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000500377  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  70.34 
 
 
127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  69.7 
 
 
173 aa  169  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3449  iojap-like protein  72.36 
 
 
138 aa  166  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467632  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  62.71 
 
 
130 aa  157  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0764  iojap-like protein  67.42 
 
 
132 aa  157  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.589269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  60 
 
 
133 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  60 
 
 
122 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  60 
 
 
122 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3853  iojap-like protein  72.88 
 
 
133 aa  150  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.782657  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3473  iojap-like protein  73.28 
 
 
132 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  59.5 
 
 
120 aa  147  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1509  iojap-like protein  59.7 
 
 
137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462296  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  55.74 
 
 
141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  59.35 
 
 
127 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000201224  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1198  iojap-like protein  60.77 
 
 
148 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11480  iojap-related protein  60.94 
 
 
148 aa  143  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  hitchhiker  0.00298358 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  57.26 
 
 
125 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  66.96 
 
 
144 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2383  iojap-like protein  56.72 
 
 
133 aa  140  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00906189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12550  iojap-related protein  68.82 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.679587  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2137  iojap-like protein  58.96 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000149501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2807  iojap-like protein  60.68 
 
 
135 aa  134  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5475  iojap-like protein  59 
 
 
141 aa  133  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219146  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2654  iojap-like protein  65.56 
 
 
120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12448  hypothetical protein  52.24 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.873041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3925  iojap-like protein  61.96 
 
 
121 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436955  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11590  iojap-related protein  54.4 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.633601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1233  Iojap-related protein  67.52 
 
 
196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0719  hypothetical protein  51.24 
 
 
137 aa  121  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00101649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1607  iojap-like protein  66.67 
 
 
191 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10180  iojap-related protein  56.7 
 
 
141 aa  120  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.168082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1637  iojap-like protein  53.54 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.418914 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  48 
 
 
142 aa  110  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1012  iojap-like protein  50.93 
 
 
140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  44.35 
 
 
118 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  48.25 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  45.76 
 
 
118 aa  98.6  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  46.46 
 
 
110 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  41.88 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  42.34 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  44.34 
 
 
116 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  43.59 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  39.32 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  39.29 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  41.9 
 
 
119 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  43.69 
 
 
107 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  44.14 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  88.6  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  40.83 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  45.38 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  41.51 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  36.5 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000986152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  36.19 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  42.86 
 
 
198 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  46.24 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  42.86 
 
 
198 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  47.78 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  36.89 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0031  iojap-like protein  35.71 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.983708  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  40.78 
 
 
191 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  44.14 
 
 
115 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0234  hypothetical protein  39.09 
 
 
119 aa  84  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  37.29 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  42.99 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  37.07 
 
 
163 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  43.88 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  44.12 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  40.57 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  36.97 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0977  Iojap-related protein  36.7 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  37.61 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.176086  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  43.43 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  36.13 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09441  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  36.11 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.120716  hitchhiker  0.0000153571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  33.63 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  41.3 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  35.29 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2515  iojap-like protein  34.78 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  39 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  37.82 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  37.96 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  36.13 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0224  Iojap-related protein  39.05 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.739057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  40 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  36.28 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  36.28 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08981  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  33.94 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  40 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  37.96 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  40.95 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0233  hypothetical protein  37.27 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08901  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  40.2 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116014 
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  33.94 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  38.68 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13821  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  40.2 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.116188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>