More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2128 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  52.93 
 
 
902 aa  828    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  100 
 
 
907 aa  1806    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  47.36 
 
 
893 aa  738    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  57.96 
 
 
881 aa  951    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  45.77 
 
 
872 aa  639    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  50 
 
 
902 aa  762    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  77.99 
 
 
976 aa  1404    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  66.05 
 
 
821 aa  866    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  45.79 
 
 
894 aa  699    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  45.74 
 
 
950 aa  733    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  51.82 
 
 
926 aa  811    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  46.79 
 
 
868 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  50.11 
 
 
899 aa  748    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  46.02 
 
 
901 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
887 aa  975    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  49.72 
 
 
899 aa  816    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  47.03 
 
 
903 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  43.1 
 
 
934 aa  626  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1240  GCN5-related N-acetyltransferase  44.05 
 
 
920 aa  615  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0677298  hitchhiker  0.00305841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  45.91 
 
 
909 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.57 
 
 
907 aa  597  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  41.65 
 
 
909 aa  592  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  39.23 
 
 
909 aa  590  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  43.31 
 
 
907 aa  589  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  40.24 
 
 
883 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  49.52 
 
 
831 aa  580  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  44.62 
 
 
926 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  40.86 
 
 
911 aa  559  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  40.26 
 
 
908 aa  555  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1998  CoA-binding domain-containing protein  39.6 
 
 
977 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0769955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  37.29 
 
 
904 aa  496  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  35.76 
 
 
886 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  36.98 
 
 
926 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 
867 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  35.37 
 
 
898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  34.13 
 
 
852 aa  426  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2950  CoA-binding  40.16 
 
 
707 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  34.82 
 
 
887 aa  422  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  36.82 
 
 
775 aa  415  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  34.02 
 
 
883 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  35.76 
 
 
698 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.93 
 
 
696 aa  405  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  36.95 
 
 
771 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  34.53 
 
 
698 aa  389  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.29 
 
 
697 aa  389  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.47 
 
 
706 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  31.38 
 
 
711 aa  362  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  32.09 
 
 
712 aa  360  9e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.85 
 
 
915 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  32.7 
 
 
911 aa  354  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.12 
 
 
699 aa  351  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.58 
 
 
697 aa  350  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  30.36 
 
 
698 aa  348  2e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31.37 
 
 
696 aa  348  4e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.2 
 
 
929 aa  347  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.27 
 
 
918 aa  347  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.63 
 
 
701 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.72 
 
 
695 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  32.6 
 
 
700 aa  331  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  39.51 
 
 
637 aa  330  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  31.83 
 
 
904 aa  320  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  30.9 
 
 
920 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.99 
 
 
669 aa  318  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.23 
 
 
711 aa  314  4.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  30.69 
 
 
707 aa  314  4.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.34 
 
 
892 aa  314  5.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  30.83 
 
 
704 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  28.86 
 
 
921 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  29.27 
 
 
905 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.41 
 
 
699 aa  306  9.000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  30.68 
 
 
697 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  29.32 
 
 
912 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.86 
 
 
892 aa  304  5.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  29.61 
 
 
698 aa  299  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
889 aa  296  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.5 
 
 
895 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.02 
 
 
897 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  31.56 
 
 
898 aa  295  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
893 aa  295  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.72 
 
 
703 aa  292  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.08 
 
 
900 aa  291  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  30.03 
 
 
893 aa  291  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  29.26 
 
 
702 aa  288  4e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  28.98 
 
 
702 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.54 
 
 
913 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  27.56 
 
 
706 aa  281  5e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  30.27 
 
 
898 aa  279  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  29.17 
 
 
911 aa  277  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  29.56 
 
 
728 aa  272  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  25.41 
 
 
714 aa  270  7e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.68 
 
 
903 aa  269  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  29.44 
 
 
903 aa  268  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  27.58 
 
 
898 aa  267  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  28.34 
 
 
900 aa  267  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
907 aa  264  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
899 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  31.47 
 
 
693 aa  263  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  29.55 
 
 
704 aa  261  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 
900 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  29.85 
 
 
727 aa  260  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>