More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2066 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  100 
 
 		 179 aa  357  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  88 
 
 		 182 aa  310  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  81.01 
 
 		 199 aa  300  8.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  84.28 
 
 		 177 aa  277  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  79.41 
 
 		 250 aa  275  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  83.97 
 
 		 222 aa  273  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  76.79 
 
 		 243 aa  272  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  74.14 
 
 		 212 aa  267  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  82.17 
 
 		 227 aa  264  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  77.65 
 
 		 168 aa  263  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  80 
 
 		 225 aa  263  7e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  80.77 
 
 		 277 aa  262  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  75.29 
 
 		 195 aa  262  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  82.17 
 
 		 204 aa  261  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  77.25 
 
 		 192 aa  259  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  74.85 
 
 		 415 aa  258  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  72.63 
 
 		 233 aa  257  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  79.87 
 
 		 204 aa  255  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  78.34 
 
 		 205 aa  255  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  75.45 
 
 		 329 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  76.36 
 
 		 351 aa  255  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  79.87 
 
 		 239 aa  254  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  78.98 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  71.86 
 
 		 401 aa  251  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  72.94 
 
 		 238 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  72.94 
 
 		 238 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  75.16 
 
 		 201 aa  249  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  72.94 
 
 		 238 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  72.35 
 
 		 243 aa  249  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  72.62 
 
 		 182 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  65.59 
 
 		 396 aa  238  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  72.61 
 
 		 356 aa  235  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  70.06 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  75.68 
 
 		 149 aa  229  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  75.54 
 
 		 175 aa  220  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  61.68 
 
 		 253 aa  214  7e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  59.43 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  62.42 
 
 		 357 aa  202  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  61.69 
 
 		 211 aa  197  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  55.49 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  58.17 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  60 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 		 165 aa  188  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  56.21 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  55.7 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  55.26 
 
 		 154 aa  178  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  54.78 
 
 		 173 aa  178  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 187 aa  177  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  53.25 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  54.43 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 		 193 aa  175  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  55.19 
 
 		 154 aa  174  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  52.23 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50.94 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  50.98 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  54.19 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  53.25 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  54.19 
 
 		 155 aa  170  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  52.26 
 
 		 178 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  49.69 
 
 		 249 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  51.19 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  52.26 
 
 		 204 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  52.29 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  54.84 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 		 174 aa  167  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 194 aa  167  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  48.72 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  48.43 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  56.03 
 
 		 145 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  52.53 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  48.39 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  48.21 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  51.28 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  51.28 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  46.51 
 
 		 238 aa  164  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>