More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2055 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2055  acetylglutamate kinase  100 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.340401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3059  acetylglutamate kinase  76.22 
 
 
333 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2153  acetylglutamate kinase  74.15 
 
 
298 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6075  Acetylglutamate kinase  73.49 
 
 
322 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733512  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3173  acetylglutamate kinase  68.29 
 
 
362 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0759623  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2029  acetylglutamate kinase  74.4 
 
 
305 aa  421  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1739  acetylglutamate kinase  72.11 
 
 
344 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5469  acetylglutamate kinase  73.01 
 
 
304 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3064  acetylglutamate kinase  68.64 
 
 
297 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0126783  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5454  acetylglutamate kinase  65.29 
 
 
300 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0243823  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1261  acetylglutamate kinase  69.26 
 
 
296 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.101538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2371  acetylglutamate kinase  63.51 
 
 
312 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0310065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1329  acetylglutamate kinase  64.73 
 
 
355 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25610  acetylglutamate kinase  67.6 
 
 
308 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1883  acetylglutamate kinase  67.73 
 
 
295 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0336877  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1890  acetylglutamate kinase  67.38 
 
 
310 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.259504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2401  acetylglutamate kinase  68.44 
 
 
301 aa  364  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2470  acetylglutamate kinase  67.73 
 
 
312 aa  359  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1113  acetylglutamate kinase  62.94 
 
 
320 aa  358  5e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4129  acetylglutamate kinase  66.55 
 
 
309 aa  352  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0223345  hitchhiker  0.000007027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1498  acetylglutamate kinase  61.89 
 
 
310 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3528  acetylglutamate kinase  62.41 
 
 
290 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3159  acetylglutamate kinase  62.33 
 
 
300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.553724  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1499  acetylglutamate kinase  59.18 
 
 
319 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000529185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3312  acetylglutamate kinase  61.7 
 
 
291 aa  341  9e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1643  acetylglutamate kinase  64.88 
 
 
335 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22310  N-acetylglutamate kinase  65.16 
 
 
338 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0338675  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2985  acetylglutamate kinase  62.99 
 
 
290 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3026  acetylglutamate kinase  63.89 
 
 
336 aa  331  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00309896  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2839  acetylglutamate kinase  58.82 
 
 
302 aa  328  6e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0122631  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0814  acetylglutamate kinase  59.18 
 
 
314 aa  328  8e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21720  N-acetylglutamate kinase  61.69 
 
 
341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11672  acetylglutamate kinase  59.45 
 
 
294 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000816294  normal  0.866365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2970  acetylglutamate kinase  62.63 
 
 
290 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.335314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3014  acetylglutamate kinase  62.63 
 
 
290 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14400  acetylglutamate kinase  61.36 
 
 
328 aa  295  8e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  49.66 
 
 
299 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  52.2 
 
 
305 aa  285  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  48.08 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  47.93 
 
 
296 aa  276  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 
295 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  49.13 
 
 
306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  49.66 
 
 
298 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  48.46 
 
 
297 aa  271  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  45.7 
 
 
290 aa  271  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 
305 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3613  acetylglutamate kinase  49.46 
 
 
288 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.522961  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  49.65 
 
 
330 aa  270  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  48.15 
 
 
296 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  45.64 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  44.06 
 
 
291 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1078  acetylglutamate kinase  48.07 
 
 
293 aa  266  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  46.85 
 
 
297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  45.89 
 
 
297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  48.43 
 
 
296 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  47.6 
 
 
292 aa  265  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  48.43 
 
 
296 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  42.66 
 
 
304 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  48.45 
 
 
298 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  47.26 
 
 
292 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  45.39 
 
 
309 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  46.88 
 
 
287 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  45.39 
 
 
309 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  47.74 
 
 
296 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  49.66 
 
 
292 aa  261  8e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  47.39 
 
 
296 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  47.74 
 
 
284 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1152  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 
289 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.749063  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 
296 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  46.02 
 
 
292 aa  259  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 
301 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  47.39 
 
 
304 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0127  acetylglutamate kinase  43.25 
 
 
294 aa  258  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.303702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  47.06 
 
 
303 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0854  acetylglutamate kinase  45.33 
 
 
283 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.277534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  45 
 
 
301 aa  256  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  47.64 
 
 
295 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  46.31 
 
 
301 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  46.31 
 
 
301 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  45.3 
 
 
301 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  45.73 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  45.79 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  47.64 
 
 
290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  47.64 
 
 
290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2911  acetylglutamate kinase  42.71 
 
 
303 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  47.2 
 
 
295 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  44.15 
 
 
302 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  45.3 
 
 
300 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 
300 aa  252  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  49.31 
 
 
293 aa  252  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  44.59 
 
 
300 aa  252  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  44.9 
 
 
303 aa  252  7e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  44.97 
 
 
301 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0887  acetylglutamate kinase  43.34 
 
 
294 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.380786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  48.25 
 
 
301 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  45.3 
 
 
293 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  45.64 
 
 
301 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  46.18 
 
 
290 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  44.41 
 
 
308 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1732  acetylglutamate kinase  47.37 
 
 
289 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>