More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2007 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
261 aa  511  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  65.73 
 
 
257 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1985  6-phosphogluconolactonase  65.46 
 
 
258 aa  291  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  60.64 
 
 
262 aa  288  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  63.86 
 
 
256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  64.2 
 
 
259 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  59.36 
 
 
260 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  71.56 
 
 
447 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3321  6-phosphogluconolactonase  63.05 
 
 
256 aa  258  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  57.66 
 
 
248 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  55.04 
 
 
272 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  57.14 
 
 
265 aa  256  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  61.45 
 
 
257 aa  251  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2092  6-phosphogluconolactonase  53.1 
 
 
272 aa  241  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2071  6-phosphogluconolactonase  59.84 
 
 
257 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  53.33 
 
 
248 aa  231  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  55.02 
 
 
494 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  51.02 
 
 
247 aa  221  8e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  53.57 
 
 
254 aa  215  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2257  6-phosphogluconolactonase  52.42 
 
 
251 aa  208  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000113878  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  52.7 
 
 
250 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2926  6-phosphogluconolactonase  50.83 
 
 
249 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  48.56 
 
 
249 aa  202  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2053  6-phosphogluconolactonase  56.45 
 
 
271 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  49.16 
 
 
245 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  49.16 
 
 
245 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  49.16 
 
 
245 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  49.8 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1553  6-phosphogluconolactonase  53.47 
 
 
249 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  55.85 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2526  6-phosphogluconolactonase  47.66 
 
 
254 aa  178  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2716  6-phosphogluconolactonase  51.5 
 
 
244 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2370  6-phosphogluconolactonase  46.31 
 
 
246 aa  174  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610167  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  34.98 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  36.71 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  41.06 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  39.36 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  33.8 
 
 
244 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  33.2 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13160  6-phosphogluconolactonase  40.33 
 
 
257 aa  132  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1243  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.21 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  44.5 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  42.92 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  36.21 
 
 
245 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  37.14 
 
 
248 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  39.3 
 
 
429 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  39.09 
 
 
241 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  36.99 
 
 
238 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  43.78 
 
 
242 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  32.37 
 
 
236 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  32.23 
 
 
236 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  34.85 
 
 
252 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  30.45 
 
 
373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  40.44 
 
 
571 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  38.75 
 
 
235 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  37.61 
 
 
252 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 
238 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  36.29 
 
 
245 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  34.54 
 
 
240 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  32.38 
 
 
241 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  41.01 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  32.52 
 
 
242 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  39.33 
 
 
242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  37.92 
 
 
245 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  33.87 
 
 
240 aa  112  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  34.02 
 
 
240 aa  111  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  31.58 
 
 
239 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  34.29 
 
 
248 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 
235 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 
235 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  32.86 
 
 
235 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  37.14 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  28.12 
 
 
232 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  31.33 
 
 
277 aa  109  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  36.94 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  35.8 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  40.56 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  37.8 
 
 
246 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  31.4 
 
 
241 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 
240 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  33.71 
 
 
238 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  32.92 
 
 
249 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  35.29 
 
 
237 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  29.44 
 
 
214 aa  106  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  38.94 
 
 
239 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  34.58 
 
 
248 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  41.2 
 
 
243 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  35.54 
 
 
241 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  30.27 
 
 
279 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  33.65 
 
 
241 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  31.44 
 
 
264 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  30.81 
 
 
238 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  29.53 
 
 
265 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  30.21 
 
 
238 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  32.55 
 
 
271 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  40.09 
 
 
243 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  31.08 
 
 
246 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  32.92 
 
 
245 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31882  predicted protein  28 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>