More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1997 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  75.12 
 
 		 211 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  55.98 
 
 		 218 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  46.23 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  41.09 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  38.68 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  33.17 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  33.17 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  33.17 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  35.54 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  32.54 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  28.85 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  29.66 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  35.51 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.94 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.48 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  27.91 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  30.77 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>