58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1995 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  100 
 
 		 351 aa  676    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  63.91 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  57.67 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  48.87 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  49.49 
 
 		 329 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  40.55 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  39.67 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  42.28 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  35.66 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  40.72 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  41.64 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  43.01 
 
 		 309 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  41.06 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.93 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  41.91 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  40.62 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.43 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  39.07 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  39.6 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  37.62 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  39.21 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  36 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  38.19 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  39.26 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  37.83 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  38.41 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  37.41 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  37.74 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  39.93 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  37.74 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  37.46 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  39.15 
 
 		 320 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  38.41 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.49 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  37.32 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  37.28 
 
 		 314 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  35.02 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  36.75 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  45.32 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  28.85 
 
 		 622 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.38 
 
 		 341 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  29.47 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  24.67 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.31 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  27.21 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  26.62 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  28.17 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  25.59 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  26.67 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  28.79 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  30 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  28.21 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  27.73 
 
 		 383 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  22.07 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  27.39 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  30.82 
 
 		 286 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  34.48 
 
 		 361 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  26.28 
 
 		 308 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>