116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1993 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  100 
 
 		 409 aa  836    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  65.94 
 
 		 414 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  53.55 
 
 		 409 aa  420  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  47.07 
 
 		 408 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1975  arginine deiminase  46.52 
 
 		 413 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  46.08 
 
 		 408 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4814  arginine deiminase  47.67 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.514213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4751  arginine deiminase  47.42 
 
 		 406 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4869  arginine deiminase  47.42 
 
 		 406 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4850  arginine deiminase  47.42 
 
 		 406 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4721  arginine deiminase  47.17 
 
 		 406 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.160752 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5202  arginine deiminase  45.68 
 
 		 409 aa  345  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  46.19 
 
 		 406 aa  342  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6443  arginine deiminase  43.81 
 
 		 417 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1145  arginine deiminase  45.45 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2128  arginine deiminase  45.45 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0244  arginine deiminase  45.45 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.177329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1968  arginine deiminase  45.45 
 
 		 425 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1987  arginine deiminase  45.45 
 
 		 425 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0915  arginine deiminase  45.45 
 
 		 425 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199485  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  43.55 
 
 		 419 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  44.69 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0432  arginine deiminase  45.81 
 
 		 409 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.277961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2384  arginine deiminase  45.59 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4537  arginine deiminase  44.96 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130916  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1585  arginine deiminase  45.21 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593064  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03644  arginine deiminase  44.96 
 
 		 406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002421  arginine deiminase  44.2 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0146  Arginine deiminase  43.24 
 
 		 418 aa  331  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.152156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2175  arginine deiminase  45.41 
 
 		 407 aa  329  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5911  arginine deiminase  41.77 
 
 		 418 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68330  arginine deiminase  41.77 
 
 		 418 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0305167  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2842  arginine deiminase  43.24 
 
 		 407 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1108  arginine deiminase  40.98 
 
 		 416 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5730  Arginine deiminase  42.18 
 
 		 434 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  43.56 
 
 		 419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3978  Arginine deiminase  41.39 
 
 		 419 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2424  arginine deiminase  43.73 
 
 		 431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  41.15 
 
 		 418 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  43.1 
 
 		 401 aa  308  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1391  arginine deiminase  43.87 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00832109  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0096  Arginine deiminase  43.24 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  43.61 
 
 		 405 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1038  arginine deiminase  42.05 
 
 		 417 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  43.32 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4223  arginine deiminase  42.09 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1000  arginine deiminase  42.23 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1001  arginine deiminase  42.23 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0746  arginine deiminase  44.63 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0880775 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  44.78 
 
 		 410 aa  300  3e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  43 
 
 		 415 aa  300  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  44.39 
 
 		 405 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4386  arginine deiminase  40.1 
 
 		 418 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11020  arginine deiminase  44.94 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00481648  normal  0.252626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4276  arginine deiminase  43.24 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4362  arginine deiminase  43.24 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0268184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4655  arginine deiminase  43.24 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  43.46 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0245  Arginine deiminase  42.47 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  42.33 
 
 		 417 aa  282  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1923  arginine deiminase  43.63 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849208  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0166  arginine deiminase  40.39 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06650  arginine deiminase  39.85 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000122198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4810  arginine deiminase  44.9 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  39.42 
 
 		 410 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0420  arginine deiminase  38.69 
 
 		 410 aa  272  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4898  arginine deiminase  38.69 
 
 		 410 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  38.44 
 
 		 410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  38.67 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0341  arginine deiminase  38.44 
 
 		 410 aa  269  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0407  arginine deiminase  38.44 
 
 		 410 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.751468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0483  arginine deiminase  37.65 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000467571  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2659  arginine deiminase  37.44 
 
 		 411 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2715  arginine deiminase  37.44 
 
 		 411 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2250  arginine deiminase  36.01 
 
 		 411 aa  255  8e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0871  arginine deiminase  33.83 
 
 		 410 aa  248  1e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0203728  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0451  arginine deiminase  35.84 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131772  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  34.83 
 
 		 414 aa  248  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  34.88 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  36.98 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3384  amidinotransferase  37.72 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  34.88 
 
 		 410 aa  239  9e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000529267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  36.45 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0157  arginine deiminase  37.71 
 
 		 413 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1949  arginine deiminase  36.23 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000474348  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0153  arginine deiminase  35.92 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  36.74 
 
 		 413 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22360  arginine deiminase  35.77 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02360  arginine deiminase  35.84 
 
 		 417 aa  229  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0263165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  34.8 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0258  Arginine deiminase  35.29 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0181  Arginine deiminase  36.04 
 
 		 405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01620  arginine deiminase  35.85 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000811385 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06540  arginine deiminase  35.61 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00222308  normal  0.406316 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf873  arginine deiminase  34.43 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07960  arginine deiminase  32.84 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000386602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  31.57 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  30.32 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0192  Arginine deiminase  28.16 
 
 		 501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5777  Arginine deiminase  28.57 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>