89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1978 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  74.32 
 
 		 319 aa  359  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  52.09 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  51.37 
 
 		 302 aa  252  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  48.67 
 
 		 261 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  50 
 
 		 263 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  46.92 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  47.45 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  46.61 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  49.22 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  45.38 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  45.67 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  44.05 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  41.44 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  41.04 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  43.87 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  40.32 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  43.02 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  44.44 
 
 		 264 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  40.96 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  41.16 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  42.58 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  39.4 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  41.96 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  40.64 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  38.74 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  41.43 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  40.82 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  41.76 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  41.9 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  39.1 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  39.5 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  38.67 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  36.1 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  39.2 
 
 		 256 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  41.96 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  41.96 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.96 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  38.97 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  36.61 
 
 		 254 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  36.82 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  37.5 
 
 		 262 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  31.47 
 
 		 234 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  31.63 
 
 		 234 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  31.66 
 
 		 210 aa  85.5  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  30.15 
 
 		 196 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  30.96 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.33 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  32.67 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  31.02 
 
 		 196 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  31.38 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  29.95 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.88 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  29.9 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  28.88 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  28.88 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  28.88 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  28.88 
 
 		 211 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  39.76 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  24.58 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  25.62 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  28.78 
 
 		 329 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 225 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  28.28 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  26.8 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  26.98 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  27.75 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  26.8 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  26.8 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  28.5 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  30.82 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  40 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  30.39 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  30.48 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  28.81 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2456  lipolytic protein G-D-S-L family  26.54 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00970732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  24.34 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.79 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.94 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  20.9 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  26.67 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  24.88 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  27.49 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.78 
 
 		 198 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  29.21 
 
 		 189 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  28.35 
 
 		 202 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  27.03 
 
 		 206 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  29.29 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>