More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1953 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  100 
 
 
382 aa  774  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  61.97 
 
 
378 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  56.35 
 
 
378 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.28 
 
 
369 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  56.88 
 
 
378 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  54.64 
 
 
383 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.21 
 
 
356 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.67 
 
 
365 aa  356  4e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.67 
 
 
365 aa  356  4e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.67 
 
 
365 aa  356  4e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  52.93 
 
 
363 aa  343  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  48.91 
 
 
411 aa  340  3e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  49.63 
 
 
391 aa  326  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.13 
 
 
364 aa  315  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  49.22 
 
 
401 aa  313  2e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  45.99 
 
 
370 aa  289  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.75954e-05  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  44.96 
 
 
412 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  47.45 
 
 
366 aa  274  2e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  46.53 
 
 
402 aa  273  2e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  42.93 
 
 
412 aa  242  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  59.3 
 
 
440 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  53.42 
 
 
452 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.43 
 
 
427 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  50.24 
 
 
218 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  49.04 
 
 
215 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  53.66 
 
 
322 aa  156  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  57.89 
 
 
137 aa  147  2e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
201 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
201 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
208 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 
253 aa  126  8e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  39.7 
 
 
205 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 
214 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
209 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.68 
 
 
205 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
209 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 
210 aa  121  2e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33 
 
 
211 aa  118  2e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.16 
 
 
213 aa  118  2e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  35.5 
 
 
213 aa  116  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.68 
 
 
202 aa  116  8e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
227 aa  115  9e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
207 aa  114  4e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 
235 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
233 aa  113  7e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 
228 aa  111  2e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  39.31 
 
 
214 aa  111  2e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.53 
 
 
203 aa  111  2e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.26 
 
 
201 aa  112  2e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.53 
 
 
203 aa  111  2e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
215 aa  110  4e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
209 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 
224 aa  109  7e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  44.7 
 
 
254 aa  109  7e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  46.4 
 
 
168 aa  109  7e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  34 
 
 
213 aa  109  8e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  48.12 
 
 
133 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
212 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
224 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  46.4 
 
 
253 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  46.4 
 
 
253 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
209 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  48.84 
 
 
132 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  36.94 
 
 
203 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
203 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  30.81 
 
 
200 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 
206 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  35.15 
 
 
227 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.22 
 
 
222 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 
222 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  41.72 
 
 
207 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
240 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  29.41 
 
 
203 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
213 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
241 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.41 
 
 
203 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
202 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 
208 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 
213 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  33 
 
 
214 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
245 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  33 
 
 
214 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.41 
 
 
203 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  38.76 
 
 
229 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.66 
 
 
201 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
200 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  42.18 
 
 
198 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
226 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
226 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 
225 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 
213 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 
207 aa  99.8  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 
207 aa  99.8  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  45.6 
 
 
226 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
207 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  45.6 
 
 
226 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
200 aa  99.4  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  45.6 
 
 
226 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
212 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
209 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>