More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1941 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.8 
 
 		 217 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.96 
 
 		 217 aa  338  5e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  77.88 
 
 		 217 aa  333  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.73 
 
 		 218 aa  323  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  72.09 
 
 		 215 aa  307  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  68.2 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  68.54 
 
 		 214 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.06 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  64.52 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  62.44 
 
 		 214 aa  278  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.9 
 
 		 218 aa  278  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.52 
 
 		 218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  64.06 
 
 		 222 aa  271  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  63.59 
 
 		 222 aa  268  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.67 
 
 		 217 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  65.44 
 
 		 231 aa  264  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.37 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.59 
 
 		 220 aa  255  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.36 
 
 		 218 aa  254  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  63.72 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.75 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.44 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  59.91 
 
 		 219 aa  242  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.22 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 218 aa  238  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.37 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  54.93 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  59.45 
 
 		 231 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.6 
 
 		 227 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  60.37 
 
 		 221 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.45 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.45 
 
 		 227 aa  224  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  58.06 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.54 
 
 		 228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 222 aa  217  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  48.18 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  46.12 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.12 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  49.32 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.41 
 
 		 223 aa  178  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.66 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  45.66 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.66 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.66 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.66 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  44.04 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.66 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.64 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  43.18 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 240 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.87 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  42.66 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2714  putative two-component response regulator  43.84 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31960  putative two-component response regulator  43.84 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.029957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.26 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.66 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 241 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.21 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.04 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  44.75 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  39.45 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>