216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1885 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  100 
 
 		 403 aa  766    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  58.38 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  45.04 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  43.37 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  43.85 
 
 		 428 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  45.58 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  45.74 
 
 		 387 aa  249  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 414 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  45.34 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  47.25 
 
 		 439 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  41.81 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  32.19 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 403 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  30.22 
 
 		 397 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  34.9 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  30.75 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  30 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 400 aa  129  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 391 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  35.22 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  32.2 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  31.11 
 
 		 383 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  31.2 
 
 		 383 aa  126  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 439 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  28.18 
 
 		 432 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  33.97 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  31.14 
 
 		 502 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 404 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.97 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 407 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 369 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.24 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.24 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.24 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  29.08 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.97 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  33.14 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 427 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1083  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 400 aa  99.8  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  26.89 
 
 		 408 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 464 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 413 aa  96.3  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  29.38 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>