More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1878 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1878  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
275 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000732842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.12 
 
 
279 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0843636  normal  0.089031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5970  enoyl-CoA hydratase  58.53 
 
 
269 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1959  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.85 
 
 
292 aa  275  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2240  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.24 
 
 
261 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000268754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2564  enoyl-CoA hydratase  50.58 
 
 
269 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3858  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.41 
 
 
252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.26 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5132  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.31 
 
 
269 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2074  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
258 aa  191  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.81 
 
 
255 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.531306  hitchhiker  0.00131508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3072  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.22 
 
 
255 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.381381  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2291  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.14 
 
 
275 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00551707  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0560  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 
246 aa  122  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.32 
 
 
659 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.95 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
254 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
255 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
273 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
269 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
259 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.24 
 
 
662 aa  109  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
264 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.88 
 
 
256 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.8 
 
 
662 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
260 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 
261 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.95 
 
 
280 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  35.27 
 
 
278 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.63 
 
 
661 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.48 
 
 
662 aa  106  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 
263 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
260 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 
259 aa  105  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
264 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
264 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
252 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 
275 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
287 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
257 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  41.36 
 
 
262 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
265 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
256 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 
267 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
257 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.95 
 
 
663 aa  102  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
258 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  30.97 
 
 
270 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.05 
 
 
271 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
287 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
268 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.07 
 
 
259 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  37.44 
 
 
267 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
268 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  32.73 
 
 
270 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
267 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
267 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 
259 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
273 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  33.05 
 
 
657 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
257 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.63 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  33.05 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 
273 aa  99.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.6 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 
248 aa  99.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 
259 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.82 
 
 
267 aa  99  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
280 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.93 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.3 
 
 
278 aa  98.6  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.81 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.19 
 
 
651 aa  98.2  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.5 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.91 
 
 
967 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  32.49 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2526  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  36.04 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.04 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.04 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  37.66 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.73 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.67 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
254 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3300  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.99 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1305  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.11 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0628711  normal  0.135664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>