223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1875 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  677    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  65.71 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  63.64 
 
 		 343 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  61.31 
 
 		 350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  60.58 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  44.16 
 
 		 342 aa  252  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  56.14 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  50.35 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  32.26 
 
 		 312 aa  156  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  30.22 
 
 		 300 aa  156  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  28.97 
 
 		 297 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  28.97 
 
 		 297 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  36.43 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  34.06 
 
 		 346 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  35.84 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  32.98 
 
 		 325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  35.62 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  36.94 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  36.57 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  36.57 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  36.57 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  36.57 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  36.57 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  36.57 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  36.57 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  36.57 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  36.57 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  32.95 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  32.32 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  32.32 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  35.5 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  32.33 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  31.94 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  31.94 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  32.58 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  31.76 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  32.59 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  32.59 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  33.68 
 
 		 524 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  34.26 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  30.45 
 
 		 524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  29.11 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  29.94 
 
 		 350 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  35.92 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  35.81 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  31.87 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  28.92 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  37.22 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  28.42 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  40.94 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  38.58 
 
 		 341 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  27.87 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  35.11 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  42.86 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25.62 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  23.94 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  25.58 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  24.04 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  26.11 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  24.29 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  35.34 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  22.49 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  28.99 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  28.91 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  28.91 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  24.08 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  25.32 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  22.86 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  30.22 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  26.5 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  25.25 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  24.58 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  30.07 
 
 		 620 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  23.79 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  29.06 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  26.2 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  26.01 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  28.15 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  36.05 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  35.14 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  23.4 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  29.01 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  33.12 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  25.69 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  33.59 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  31.68 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  29.09 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  26.92 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  35.71 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  26.8 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  33.72 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  29.17 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  31.72 
 
 		 475 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  24.51 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  24.78 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  23.85 
 
 		 324 aa  50.4  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  24.34 
 
 		 353 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  28.26 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  27.23 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  33.33 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>