More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1847 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
252 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  74.49 
 
 
255 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  71.73 
 
 
256 aa  342  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  69.2 
 
 
247 aa  339  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  65.34 
 
 
277 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  64.58 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  67.1 
 
 
455 aa  310  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  66.95 
 
 
268 aa  310  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  67.37 
 
 
250 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.95 
 
 
274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  64.81 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  70.18 
 
 
257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  63.95 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  64.2 
 
 
258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  64.94 
 
 
262 aa  301  9e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  66.96 
 
 
445 aa  300  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  63.79 
 
 
259 aa  300  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  60.32 
 
 
264 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  63.2 
 
 
255 aa  299  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.13 
 
 
264 aa  298  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  62.34 
 
 
255 aa  298  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  63.87 
 
 
253 aa  297  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  65.67 
 
 
258 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  67.76 
 
 
250 aa  295  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  62.18 
 
 
277 aa  295  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  63.44 
 
 
266 aa  292  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  60 
 
 
258 aa  288  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  57.31 
 
 
291 aa  288  8e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.44 
 
 
280 aa  287  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  61.6 
 
 
255 aa  287  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  64.38 
 
 
263 aa  286  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  60.16 
 
 
288 aa  285  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  63.56 
 
 
253 aa  281  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  58.68 
 
 
247 aa  280  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  64.41 
 
 
258 aa  278  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  58.15 
 
 
279 aa  276  3e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  59.83 
 
 
261 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  62.93 
 
 
312 aa  272  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  55.69 
 
 
279 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60.43 
 
 
245 aa  271  6e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  62.77 
 
 
255 aa  270  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  61.78 
 
 
244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  60.42 
 
 
302 aa  269  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  54.89 
 
 
252 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  58.12 
 
 
257 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  54.66 
 
 
256 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  59.91 
 
 
293 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
245 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  54.77 
 
 
266 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  58.65 
 
 
277 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  58.95 
 
 
255 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  58.4 
 
 
241 aa  254  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  54.89 
 
 
243 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  52.42 
 
 
253 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  51.69 
 
 
269 aa  251  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  51.05 
 
 
244 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  56.5 
 
 
272 aa  242  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  54.35 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  55.04 
 
 
248 aa  239  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  54.43 
 
 
249 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  57.87 
 
 
224 aa  238  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  51.25 
 
 
279 aa  234  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  57.68 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  47.03 
 
 
240 aa  229  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  57.2 
 
 
249 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
227 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.54 
 
 
228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  48.96 
 
 
271 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  46.08 
 
 
226 aa  222  3e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  50.85 
 
 
255 aa  222  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  53.3 
 
 
239 aa  221  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.52 
 
 
233 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  48.34 
 
 
225 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  53.12 
 
 
238 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  52.89 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  47.09 
 
 
227 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.3 
 
 
228 aa  214  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  43.44 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  50.46 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.14 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.85 
 
 
230 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.07 
 
 
230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  46.48 
 
 
225 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.66 
 
 
229 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.68 
 
 
653 aa  211  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  49.55 
 
 
240 aa  211  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  48.64 
 
 
238 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  45.95 
 
 
226 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.46 
 
 
246 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.62 
 
 
229 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  47.19 
 
 
232 aa  210  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  47.93 
 
 
230 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  47.51 
 
 
237 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.02 
 
 
251 aa  210  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 
246 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  47.49 
 
 
230 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  48.86 
 
 
228 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.87 
 
 
235 aa  208  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  208  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  48.62 
 
 
222 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>