87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1826 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  64.18 
 
 
284 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  63.64 
 
 
279 aa  346  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  62.59 
 
 
284 aa  343  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  59.29 
 
 
282 aa  341  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  63.76 
 
 
286 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  62.03 
 
 
294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  56.74 
 
 
283 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  59.11 
 
 
283 aa  309  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  57.55 
 
 
280 aa  308  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  58.67 
 
 
285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  54.29 
 
 
286 aa  305  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  57.88 
 
 
298 aa  301  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  54.74 
 
 
306 aa  298  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  55.09 
 
 
301 aa  297  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  53.76 
 
 
288 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  56.12 
 
 
280 aa  296  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  55.85 
 
 
301 aa  295  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  52.28 
 
 
296 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  55.02 
 
 
290 aa  291  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  56.3 
 
 
283 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  51.77 
 
 
292 aa  289  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  53.07 
 
 
296 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  53.07 
 
 
296 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  50.88 
 
 
301 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  54.81 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  53.31 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  52.71 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  50.53 
 
 
289 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  50.53 
 
 
289 aa  278  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  52.16 
 
 
292 aa  275  7e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  48.87 
 
 
269 aa  255  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  46.76 
 
 
282 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  48.3 
 
 
296 aa  251  7e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  49.63 
 
 
286 aa  246  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  48.75 
 
 
316 aa  239  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  44.93 
 
 
297 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  44.56 
 
 
299 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  38.73 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  37.31 
 
 
284 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  29.63 
 
 
277 aa  143  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  33.57 
 
 
311 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  31.01 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  31.4 
 
 
315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  28.47 
 
 
329 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  30.32 
 
 
311 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  28.47 
 
 
330 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  27.76 
 
 
334 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  27.76 
 
 
334 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  30.18 
 
 
307 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  27.74 
 
 
304 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  27.76 
 
 
334 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  27.34 
 
 
301 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  28.32 
 
 
312 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  26.67 
 
 
302 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  27.84 
 
 
313 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  29.27 
 
 
298 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  30.13 
 
 
325 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.14 
 
 
348 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  28.42 
 
 
314 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  29.64 
 
 
306 aa  99  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  28.01 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  27.56 
 
 
342 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  29.07 
 
 
304 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  28.67 
 
 
324 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  25.71 
 
 
307 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  27.99 
 
 
353 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  29.25 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  29.32 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  24.64 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  27.08 
 
 
312 aa  89  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  28.67 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  24.19 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  26.67 
 
 
312 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  26.74 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  25.61 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  28.11 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  22.71 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  25.63 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  22.92 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  22.92 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  22.92 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  24.37 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  22.68 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  23.02 
 
 
302 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  21.72 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  22 
 
 
256 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>