More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1825 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  48.35 
 
 
1183 aa  1091    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  38.7 
 
 
1132 aa  753    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  45.46 
 
 
1182 aa  1036    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.13 
 
 
1132 aa  760    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  38.96 
 
 
1132 aa  740    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  76.6 
 
 
1157 aa  1826    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  70.46 
 
 
1178 aa  1678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.39 
 
 
1132 aa  755    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.06 
 
 
1133 aa  754    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.06 
 
 
1133 aa  756    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  68.55 
 
 
1173 aa  1595    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  68.09 
 
 
1171 aa  1563    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  76.53 
 
 
1154 aa  1818    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 
1158 aa  2362    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  45.71 
 
 
1182 aa  1042    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  44.51 
 
 
1187 aa  1045    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  42.88 
 
 
1196 aa  876    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  49.19 
 
 
1178 aa  1079    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  47.26 
 
 
1191 aa  1068    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  71.12 
 
 
1169 aa  1677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  44.87 
 
 
1150 aa  850    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  47.35 
 
 
1191 aa  1066    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  50.47 
 
 
1171 aa  1073    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  64.91 
 
 
1181 aa  1499    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  47.36 
 
 
1208 aa  1037    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  79.03 
 
 
1156 aa  1874    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  48.61 
 
 
1208 aa  1060    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  41.99 
 
 
1189 aa  853    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.39 
 
 
1132 aa  755    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  42.34 
 
 
1163 aa  921    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  45.02 
 
 
1188 aa  1052    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  49.45 
 
 
1190 aa  1063    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  49.87 
 
 
1182 aa  1069    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  68.44 
 
 
1184 aa  1609    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  44.58 
 
 
1150 aa  868    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  65.04 
 
 
1199 aa  1502    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  66.75 
 
 
1193 aa  1552    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  55.06 
 
 
1151 aa  1164    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  41.86 
 
 
1156 aa  914    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  45 
 
 
1191 aa  1014    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  74.2 
 
 
1154 aa  1794    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  41.58 
 
 
1180 aa  865    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  44.85 
 
 
1188 aa  1041    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  67.91 
 
 
1192 aa  1623    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  44.66 
 
 
1149 aa  846    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.05 
 
 
1132 aa  761    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  39.51 
 
 
1169 aa  795    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  68.94 
 
 
1195 aa  1578    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  50.25 
 
 
1215 aa  1109    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.47 
 
 
1132 aa  755    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  42.62 
 
 
1208 aa  878    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  47.32 
 
 
1197 aa  1045    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  46.69 
 
 
1224 aa  1052    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  41.43 
 
 
1136 aa  804    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  50.46 
 
 
1168 aa  1103    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  68.18 
 
 
1167 aa  1552    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  48.55 
 
 
1176 aa  1069    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  38.7 
 
 
1132 aa  746    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  63.28 
 
 
1216 aa  1470    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  44.77 
 
 
1188 aa  1041    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  41.86 
 
 
1254 aa  861    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  68.74 
 
 
1158 aa  1593    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.84 
 
 
1132 aa  754    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  44.87 
 
 
1150 aa  848    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  41.15 
 
 
1136 aa  803    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  67.4 
 
 
1176 aa  1583    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  63.04 
 
 
1214 aa  1466    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  47.51 
 
 
1212 aa  1061    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  49.88 
 
 
1223 aa  1110    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  48.7 
 
 
1214 aa  1068    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  35.59 
 
 
1237 aa  617  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  35.81 
 
 
1236 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  35.27 
 
 
1232 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  33.15 
 
 
1274 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  34.08 
 
 
1266 aa  594  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  34.17 
 
 
1262 aa  595  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  33.36 
 
 
1267 aa  590  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  34.75 
 
 
1245 aa  592  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  32.84 
 
 
1233 aa  586  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  34.08 
 
 
1245 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  34.3 
 
 
1232 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  33.77 
 
 
1238 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  34.25 
 
 
1250 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3799  methionine synthase  32.95 
 
 
1219 aa  582  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  32.73 
 
 
1226 aa  582  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  33.28 
 
 
1239 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  34.1 
 
 
1245 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.28 
 
 
1226 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  34.43 
 
 
1251 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  34.94 
 
 
1247 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  34.18 
 
 
1227 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  34.04 
 
 
1236 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  34.29 
 
 
1237 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  33.8 
 
 
1278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  32.68 
 
 
1241 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  34.38 
 
 
1264 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  33.22 
 
 
1227 aa  571  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  32.37 
 
 
1238 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  33.91 
 
 
1243 aa  570  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  33.33 
 
 
1227 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>