More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1741 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1741  threonine dehydratase  100 
 
 
310 aa  608  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0307895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1852  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  66.44 
 
 
307 aa  335  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1622  Threonine ammonia-lyase  65.44 
 
 
307 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2783  threonine dehydratase  52.35 
 
 
302 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0061  threonine dehydratase  50 
 
 
313 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.983835  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3496  threonine dehydratase  46.38 
 
 
310 aa  192  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3420  threonine dehydratase  49.17 
 
 
309 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2922  threonine dehydratase  43.15 
 
 
313 aa  170  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4798  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  44.21 
 
 
336 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2589  threonine dehydratase  45.76 
 
 
303 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  38.31 
 
 
403 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.09 
 
 
304 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  38.28 
 
 
403 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.13 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3768  threonine dehydratase  46.42 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  40.47 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.22 
 
 
320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3011  threonine dehydratase  41.98 
 
 
317 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  37.72 
 
 
408 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  37.18 
 
 
402 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  38.28 
 
 
403 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  36.42 
 
 
405 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  40.15 
 
 
403 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  36.48 
 
 
304 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  34.6 
 
 
402 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  38.44 
 
 
403 aa  159  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  29.87 
 
 
404 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4030  threonine dehydratase  43.73 
 
 
320 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  36.68 
 
 
418 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  33.45 
 
 
402 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0008  hypothetical protein  38.03 
 
 
320 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  38.03 
 
 
320 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.13 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  0.218028 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  41.52 
 
 
403 aa  152  7e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  37.88 
 
 
414 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  39.02 
 
 
402 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  37.7 
 
 
320 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  39.08 
 
 
321 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  39.58 
 
 
321 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  36.42 
 
 
406 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  36.93 
 
 
402 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2738  threonine dehydratase  37.62 
 
 
317 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  38.11 
 
 
402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  35.5 
 
 
403 aa  146  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1558  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.67 
 
 
322 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.813791  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  36.33 
 
 
507 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.39 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1533  threonine dehydratase  39.45 
 
 
402 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  35.03 
 
 
501 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  38.39 
 
 
403 aa  144  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  40.68 
 
 
520 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  37.29 
 
 
411 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  32.9 
 
 
400 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2700  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.79 
 
 
321 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  31.07 
 
 
403 aa  143  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  41.18 
 
 
403 aa  142  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3920  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.37 
 
 
315 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903955  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  36.3 
 
 
403 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0227  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.38 
 
 
353 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  36 
 
 
509 aa  142  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.61 
 
 
310 aa  142  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  32.25 
 
 
403 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1010  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.47 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.929985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  35.37 
 
 
511 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  35.55 
 
 
517 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40 
 
 
315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  39.42 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0888  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.59 
 
 
324 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  38.18 
 
 
509 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  36.67 
 
 
506 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.24 
 
 
332 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  36.67 
 
 
506 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  36.16 
 
 
403 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1722  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.53 
 
 
320 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4888  putative threonine dehydratase, catabolic  30.84 
 
 
325 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  32.31 
 
 
511 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  35.62 
 
 
403 aa  139  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  35.44 
 
 
517 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02608  threonine dehydratase  37.58 
 
 
356 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  32.31 
 
 
511 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  36.77 
 
 
415 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  30.29 
 
 
403 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  38.78 
 
 
344 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2937  threonine dehydratase  38.67 
 
 
418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  36.73 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0996  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.74 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100397  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  31.77 
 
 
395 aa  136  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  36.88 
 
 
402 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  30.29 
 
 
403 aa  136  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2376  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.61 
 
 
317 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  35.5 
 
 
402 aa  135  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  36.96 
 
 
400 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.11 
 
 
504 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.77 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  38.61 
 
 
402 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.94 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0952  threonine dehydratase  42.41 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  39.78 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  38.11 
 
 
504 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  39.78 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>