More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1733 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1733  putative acyl-CoA synthetase, long-chain-fatty acid:CoA ligase  100 
 
 		 614 aa  1221    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.961848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 		 710 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000363453  hitchhiker  0.00000721686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.61 
 
 		 599 aa  276  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 596 aa  273  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 599 aa  273  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.01 
 
 		 602 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 615 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 597 aa  267  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 606 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 604 aa  263  6e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 597 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.84 
 
 		 612 aa  261  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 605 aa  261  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 608 aa  259  9e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 602 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 619 aa  259  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.6 
 
 		 599 aa  259  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 602 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 622 aa  254  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 600 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 599 aa  253  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.46 
 
 		 598 aa  253  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 616 aa  251  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 606 aa  250  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 597 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 612 aa  249  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.01 
 
 		 611 aa  248  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 609 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 602 aa  247  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 		 606 aa  246  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 601 aa  246  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 599 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.82 
 
 		 606 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 615 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 604 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 593 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 601 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 600 aa  244  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 603 aa  244  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 602 aa  243  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 607 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 591 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 597 aa  241  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 597 aa  241  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 		 599 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 597 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  30.95 
 
 		 600 aa  240  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  29.7 
 
 		 618 aa  237  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 599 aa  237  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 590 aa  233  9e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.28 
 
 		 606 aa  232  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 632 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  29.6 
 
 		 679 aa  227  6e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  27.49 
 
 		 603 aa  221  3.9999999999999997e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 609 aa  220  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 604 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 604 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  27.08 
 
 		 677 aa  207  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  28.4 
 
 		 607 aa  207  5e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 604 aa  203  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 607 aa  200  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  28.57 
 
 		 682 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 617 aa  198  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 649 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 610 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 		 605 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 598 aa  190  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  26.86 
 
 		 597 aa  190  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  28.08 
 
 		 701 aa  189  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  27.05 
 
 		 594 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 606 aa  187  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 		 606 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 607 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  25.78 
 
 		 602 aa  183  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 		 606 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 613 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 633 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 622 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 		 630 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 		 645 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 622 aa  168  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 		 633 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 635 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522834  normal  0.0456544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  24.87 
 
 		 596 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  24.87 
 
 		 607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  27.5 
 
 		 620 aa  165  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  26.05 
 
 		 649 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 598 aa  163  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 		 603 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  25.56 
 
 		 651 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  23.84 
 
 		 598 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  25.86 
 
 		 601 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 		 601 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  25.86 
 
 		 601 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 646 aa  161  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 612 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 		 601 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>