239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1714 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1714  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  962    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.007229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.65 
 
 
493 aa  348  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  38.21 
 
 
498 aa  343  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  41.41 
 
 
496 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  41.41 
 
 
496 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  41.41 
 
 
496 aa  330  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  37.95 
 
 
490 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  35.1 
 
 
494 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  41.07 
 
 
494 aa  323  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  39.2 
 
 
499 aa  319  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.67 
 
 
503 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.61 
 
 
491 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  37.53 
 
 
506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  37.3 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  39.71 
 
 
508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  40.95 
 
 
498 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  40.9 
 
 
498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  38.48 
 
 
502 aa  302  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.93 
 
 
514 aa  302  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  38.06 
 
 
500 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.81 
 
 
519 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  37.12 
 
 
504 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  37.4 
 
 
505 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  37.65 
 
 
499 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.9 
 
 
514 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  37.64 
 
 
507 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.42 
 
 
503 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.11 
 
 
502 aa  296  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  35.42 
 
 
500 aa  295  9e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  35.7 
 
 
499 aa  295  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  38.46 
 
 
502 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.97 
 
 
516 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  35.43 
 
 
500 aa  293  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  34.83 
 
 
500 aa  292  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  34.89 
 
 
519 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  37.9 
 
 
501 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.33 
 
 
506 aa  290  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  36.02 
 
 
500 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.49 
 
 
501 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.59 
 
 
504 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  40.05 
 
 
500 aa  289  7e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.75 
 
 
501 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.88 
 
 
536 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  38.6 
 
 
494 aa  288  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  35.25 
 
 
500 aa  287  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.76 
 
 
500 aa  286  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  33.67 
 
 
502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  37.5 
 
 
502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  38.98 
 
 
499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.11 
 
 
500 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.9 
 
 
497 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  36.05 
 
 
505 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.56 
 
 
500 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1976  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.02 
 
 
488 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.49 
 
 
500 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  35.76 
 
 
500 aa  280  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.06 
 
 
503 aa  280  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  35.99 
 
 
500 aa  280  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.07 
 
 
508 aa  279  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  37.47 
 
 
658 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  38.09 
 
 
529 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33.33 
 
 
531 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  37.04 
 
 
506 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33.54 
 
 
515 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  35.16 
 
 
506 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  36.16 
 
 
501 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.07 
 
 
520 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  36.21 
 
 
504 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  37.14 
 
 
515 aa  276  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  36.01 
 
 
512 aa  276  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.16 
 
 
502 aa  276  8e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  36.03 
 
 
504 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  34.28 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  34.28 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  34.28 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  36.63 
 
 
506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  36.28 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  34.28 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  34.28 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.96 
 
 
501 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.05 
 
 
511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  37.69 
 
 
658 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.89 
 
 
505 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  36.74 
 
 
505 aa  273  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.59 
 
 
500 aa  273  6e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  37.76 
 
 
502 aa  273  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  34.82 
 
 
504 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  35.63 
 
 
504 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  34.72 
 
 
505 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  34.8 
 
 
504 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  35.86 
 
 
505 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  36.64 
 
 
502 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  35.28 
 
 
500 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.18 
 
 
509 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0726  hypothetical protein  34.02 
 
 
502 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  36.33 
 
 
496 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  34.72 
 
 
508 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  36.13 
 
 
503 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  39.61 
 
 
508 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  36.72 
 
 
500 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>