More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1711 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  42.38 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  40.55 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0156  gluconate operon transcriptional repressor  33.8 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0154  gluconate operon transcriptional repressor  33.8 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0183  gluconate operon transcriptional repressor  33.8 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0162  gluconate operon transcriptional repressor  33.33 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0205  gluconate operon transcriptional repressor  33.8 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0161  gluconate operon transcriptional repressor  33.33 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  37.86 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  39.63 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2059  gluconate operon transcriptional repressor  32.05 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2582  gluconate operon transcriptional repressor  28.08 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.623222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2530  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4314  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  29.53 
 
 		 218 aa  85.1  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  29.41 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1653  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4322  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  33.53 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2382  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  0.779059 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1449  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>