More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1692 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  100 
 
 
281 aa  547  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.77 
 
 
287 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.62 
 
 
278 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  60.08 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  54.96 
 
 
272 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.62 
 
 
298 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  60 
 
 
283 aa  275  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.07 
 
 
279 aa  232  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.84 
 
 
275 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
280 aa  218  7e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.08 
 
 
259 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.06 
 
 
289 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.06 
 
 
283 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.06 
 
 
283 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6360  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  40.95 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.821284  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
277 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
256 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
280 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
255 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.61 
 
 
261 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.64 
 
 
290 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  37.86 
 
 
284 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
315 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
279 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  35.62 
 
 
298 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
258 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  35.94 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
279 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
283 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
263 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21990  ABC transporter, inner membrane permease component  34.88 
 
 
273 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.91 
 
 
279 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
263 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
253 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
285 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
283 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  35.42 
 
 
279 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
285 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
273 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 
282 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.44 
 
 
282 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  37.45 
 
 
283 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  34.6 
 
 
280 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
289 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
252 aa  136  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
265 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  39.13 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 
286 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
252 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.45 
 
 
277 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
265 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88893  normal  0.0504928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
260 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  38.96 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.4 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  35.98 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  38.59 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  35.56 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
264 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  33.73 
 
 
252 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  34.06 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  33.48 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  34.06 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1482  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.33 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  34.75 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  34.93 
 
 
272 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  38.91 
 
 
279 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  34.6 
 
 
274 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 
272 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.07 
 
 
279 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
264 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  34.75 
 
 
264 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>