More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1652 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  58.59 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  58.5 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.02 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.49 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  48.03 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.21 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  48 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.35 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.4 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  42.62 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  46.67 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.37 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.37 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  42.06 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.33 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  39.69 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  36.26 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  36.15 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.35 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.19 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  31.53 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  31.96 
 
 		 251 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  32.73 
 
 		 247 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  32.95 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  32.88 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  28.12 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  34.85 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  33.78 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  29.82 
 
 		 246 aa  92  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 		 254 aa  92  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  27.2 
 
 		 302 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.63 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 309 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  39.53 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 		 299 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  32.81 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  33.18 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  38.51 
 
 		 321 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  31.36 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  31.36 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  30.32 
 
 		 250 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.89 
 
 		 308 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  31.94 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  31.53 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  25.79 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 		 321 aa  85.9  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 		 258 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  30.3 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  30.3 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  32.3 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  26.67 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.24 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  25.78 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  29.05 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  30.59 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  30.38 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  28.32 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  27.67 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  31.25 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  33.8 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  30.54 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  29.18 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  30.83 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  26.24 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.92 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  31.28 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  27.03 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  28.29 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  28.29 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  31.03 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  33.33 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 		 318 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 		 301 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  29.11 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  30.56 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  32.9 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>