More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1649 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1244  Catalase  65.97 
 
 
487 aa  669    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6791  catalase  65.68 
 
 
507 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0449  Catalase  68 
 
 
485 aa  685    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3730  catalase  76.21 
 
 
506 aa  788    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3238  Catalase  67.69 
 
 
510 aa  689    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.067006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  64.89 
 
 
494 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04660  catalase  68.61 
 
 
504 aa  706    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651811  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0222  Catalase  69.96 
 
 
484 aa  687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  100 
 
 
555 aa  1154    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1308  catalase  67.73 
 
 
480 aa  686    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1101  Catalase  65.26 
 
 
481 aa  642    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.384767  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0803  catalase  69.52 
 
 
487 aa  715    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0804  catalase  74.47 
 
 
499 aa  774    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0843  catalase  74.47 
 
 
499 aa  774    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24970  catalase  73.4 
 
 
497 aa  736    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09640  catalase  67.28 
 
 
535 aa  698    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023552  normal  0.0698912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22460  catalase  65.76 
 
 
499 aa  662    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  89.38 
 
 
499 aa  944    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3078  catalase  65.53 
 
 
499 aa  651    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1236  Catalase  69.28 
 
 
483 aa  694    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0619868  normal  0.69126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2094  catalase  69.36 
 
 
482 aa  697    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.615987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5493  catalase  66.67 
 
 
482 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.620099  normal  0.0567456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1622  Catalase  67.23 
 
 
500 aa  667    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468937  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2517  Catalase  67.71 
 
 
509 aa  688    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1629  Catalase  65.96 
 
 
508 aa  677    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.303359  normal  0.0939595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0236  catalase  61.86 
 
 
482 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0517  Catalase  61.23 
 
 
483 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  56.25 
 
 
498 aa  544  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  56.26 
 
 
479 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  56.05 
 
 
479 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  56.05 
 
 
479 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  55.84 
 
 
479 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  53.7 
 
 
507 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  55.67 
 
 
504 aa  522  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  55.91 
 
 
485 aa  522  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  55.01 
 
 
505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  53.6 
 
 
484 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  53.54 
 
 
486 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  53.12 
 
 
486 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  53.53 
 
 
486 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  52.61 
 
 
491 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  52.81 
 
 
493 aa  502  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  52.82 
 
 
491 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  52.92 
 
 
486 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  52.07 
 
 
488 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  52.16 
 
 
487 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  54.18 
 
 
493 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  52.75 
 
 
481 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  52.71 
 
 
491 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  52.6 
 
 
486 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  53.15 
 
 
480 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  52.68 
 
 
485 aa  500  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  52.5 
 
 
486 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0273  catalase  52.43 
 
 
474 aa  496  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  50.74 
 
 
501 aa  497  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  52.19 
 
 
491 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  53.36 
 
 
480 aa  498  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3054  catalase  53.66 
 
 
499 aa  492  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2706  Catalase  52.73 
 
 
499 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  52.01 
 
 
474 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0355  catalase  53.66 
 
 
499 aa  491  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.692778  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5439  Catalase  55.86 
 
 
485 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  51.59 
 
 
478 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  54.24 
 
 
501 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  51.8 
 
 
474 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  50.72 
 
 
479 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  52.01 
 
 
474 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0322  catalase  53.66 
 
 
499 aa  491  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  50.95 
 
 
481 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0269  catalase  55.28 
 
 
504 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146052  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  51.77 
 
 
487 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  52 
 
 
490 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2262  catalase-like  55.1 
 
 
477 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2489  catalase  53.15 
 
 
484 aa  488  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.350666  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  53.53 
 
 
488 aa  488  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  53.81 
 
 
485 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  52.71 
 
 
566 aa  484  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  53.44 
 
 
478 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1165  Catalase  52.62 
 
 
547 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5599  catalase  52.15 
 
 
481 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.555062  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0383  catalase  52.37 
 
 
494 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  50.83 
 
 
493 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  50.21 
 
 
480 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1421  catalase  52.73 
 
 
488 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898508  normal  0.0406547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2779  catalase  52.42 
 
 
488 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  50.21 
 
 
484 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4001  catalase  51.72 
 
 
487 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  53.7 
 
 
487 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0712  Catalase  50 
 
 
484 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  52.61 
 
 
496 aa  475  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  49.37 
 
 
482 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  50.75 
 
 
484 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0342  Catalase  60.96 
 
 
556 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1759  Catalase  50.11 
 
 
483 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191846  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  50.95 
 
 
483 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  51.28 
 
 
490 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  52.13 
 
 
490 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  48.52 
 
 
482 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  52.14 
 
 
490 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1494  Catalase  53.77 
 
 
485 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0618429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>