More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1641 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  100 
 
 		 440 aa  895    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  73.64 
 
 		 440 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  68.15 
 
 		 441 aa  617  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 441 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  65.26 
 
 		 430 aa  584  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 416 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  61.92 
 
 		 446 aa  561  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  62.24 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  60.28 
 
 		 437 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  59.86 
 
 		 438 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  61.68 
 
 		 454 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  59.91 
 
 		 437 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  59.22 
 
 		 437 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  59.07 
 
 		 611 aa  521  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  55.91 
 
 		 438 aa  511  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  58.68 
 
 		 436 aa  502  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  55.92 
 
 		 436 aa  502  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  59.66 
 
 		 416 aa  501  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  57.7 
 
 		 446 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  56.86 
 
 		 414 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  50.89 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  49.75 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  44 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  45.1 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  42.07 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  43.73 
 
 		 416 aa  350  2e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.55 
 
 		 400 aa  327  4.0000000000000003e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  43.15 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  40.25 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 386 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 409 aa  312  9e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 395 aa  312  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 399 aa  310  4e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 395 aa  299  8e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  38.48 
 
 		 401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  37.16 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 411 aa  279  8e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  39.68 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 396 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  38.67 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 396 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  35.97 
 
 		 406 aa  272  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 394 aa  272  9e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  39.53 
 
 		 394 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  36.55 
 
 		 397 aa  270  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 411 aa  270  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  37.06 
 
 		 397 aa  270  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 395 aa  269  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 398 aa  269  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.64 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 407 aa  266  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  36.91 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  40.21 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  36.76 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 408 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 405 aa  263  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  36.66 
 
 		 420 aa  263  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.26 
 
 		 426 aa  262  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 426 aa  262  8e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  36.5 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  36.41 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  41.37 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  36.76 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 401 aa  260  4e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 394 aa  260  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 		 416 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.5 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.5 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  36.91 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  36.91 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  36.91 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  36.91 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.02 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  36.91 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  36.91 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>