More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1627 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 
998 aa  2034    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  70.6 
 
 
864 aa  1041    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.02 
 
 
927 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  55.74 
 
 
1100 aa  796    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  64.62 
 
 
851 aa  881    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  48 
 
 
1105 aa  710    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  65.14 
 
 
762 aa  936    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.77 
 
 
786 aa  763    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  50.27 
 
 
875 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  44.57 
 
 
895 aa  568  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  43.59 
 
 
1224 aa  553  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  54.29 
 
 
775 aa  551  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  50.61 
 
 
812 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  36.57 
 
 
885 aa  505  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.92 
 
 
867 aa  496  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  35.11 
 
 
874 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.14 
 
 
611 aa  366  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  34.67 
 
 
854 aa  278  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.99 
 
 
582 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  32.93 
 
 
571 aa  266  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  34.84 
 
 
578 aa  260  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  32.41 
 
 
591 aa  258  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  31.79 
 
 
587 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  30.97 
 
 
646 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  30.33 
 
 
649 aa  221  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 
1601 aa  217  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  53.59 
 
 
880 aa  210  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  28.12 
 
 
833 aa  185  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  30.52 
 
 
537 aa  183  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  47.85 
 
 
681 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  44.1 
 
 
727 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  49.75 
 
 
743 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.61 
 
 
900 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.31 
 
 
847 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  44.55 
 
 
543 aa  141  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  42.18 
 
 
438 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  46.34 
 
 
523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  26.24 
 
 
739 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  44.88 
 
 
978 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  41.86 
 
 
429 aa  128  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  42.59 
 
 
460 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  46.84 
 
 
393 aa  125  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  58.82 
 
 
611 aa  125  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  42.58 
 
 
1007 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  47.54 
 
 
543 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  39.49 
 
 
608 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  53.21 
 
 
785 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  36.16 
 
 
990 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  56.07 
 
 
580 aa  121  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  57.69 
 
 
589 aa  121  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  39.57 
 
 
938 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.86 
 
 
979 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  55.88 
 
 
620 aa  118  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  51.92 
 
 
489 aa  118  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  54.21 
 
 
767 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  36.71 
 
 
637 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  26.37 
 
 
665 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  38.76 
 
 
1137 aa  115  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  55 
 
 
966 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 
632 aa  115  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  53.47 
 
 
963 aa  115  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  37.96 
 
 
679 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  51.49 
 
 
376 aa  112  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  37.56 
 
 
699 aa  111  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  49.09 
 
 
669 aa  110  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  34.56 
 
 
385 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 
658 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.94 
 
 
469 aa  110  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  50.47 
 
 
423 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  34.95 
 
 
674 aa  108  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  39.79 
 
 
973 aa  108  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  51.46 
 
 
934 aa  108  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  50 
 
 
623 aa  107  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  39.32 
 
 
655 aa  106  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  48.6 
 
 
494 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  34.22 
 
 
674 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  34.41 
 
 
674 aa  106  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  50 
 
 
913 aa  106  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  39.45 
 
 
1121 aa  105  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  32.09 
 
 
674 aa  104  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  50 
 
 
842 aa  104  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  33.16 
 
 
674 aa  104  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  33.16 
 
 
674 aa  104  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  47.57 
 
 
442 aa  104  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  33.16 
 
 
674 aa  104  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  33.69 
 
 
674 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  33.16 
 
 
674 aa  104  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  49.02 
 
 
778 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  47.66 
 
 
690 aa  102  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  32.62 
 
 
674 aa  102  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  47.66 
 
 
854 aa  102  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  47.06 
 
 
688 aa  101  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  25.56 
 
 
978 aa  101  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  39.44 
 
 
900 aa  101  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.48 
 
 
491 aa  101  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.66 
 
 
646 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  34.22 
 
 
674 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  45.63 
 
 
436 aa  100  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  49.51 
 
 
597 aa  99.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  42.86 
 
 
719 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>