More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1505 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  100 
 
 
262 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  63.31 
 
 
288 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  53.67 
 
 
261 aa  266  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.05 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.67 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 
260 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  54.3 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.23 
 
 
263 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.19 
 
 
280 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  49.61 
 
 
271 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  50.2 
 
 
267 aa  239  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  50.4 
 
 
271 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  50.4 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  52.23 
 
 
267 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.31 
 
 
254 aa  238  9e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  49.81 
 
 
263 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.8 
 
 
264 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
278 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  54.88 
 
 
267 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  51.57 
 
 
251 aa  237  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  51.59 
 
 
265 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  47.62 
 
 
258 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.71 
 
 
254 aa  235  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 
260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.99 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.15 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.06 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  50 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.12 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 
264 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 
261 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 
265 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  48.22 
 
 
265 aa  233  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 
259 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  49.62 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.57 
 
 
263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  49.6 
 
 
267 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.95 
 
 
271 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  50.79 
 
 
265 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.45 
 
 
259 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  49.58 
 
 
251 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 
271 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  50.4 
 
 
265 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  50.81 
 
 
262 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4846  ABC transporter related protein  52.87 
 
 
257 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.31 
 
 
254 aa  230  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  49.01 
 
 
264 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  48.28 
 
 
262 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  49.6 
 
 
272 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.22 
 
 
304 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  49.81 
 
 
292 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.67 
 
 
261 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  46.77 
 
 
267 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  50.4 
 
 
265 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  50 
 
 
270 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  50.4 
 
 
265 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.95 
 
 
271 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  53.62 
 
 
261 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  47.15 
 
 
267 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  50.85 
 
 
259 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.15 
 
 
263 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.59 
 
 
261 aa  228  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  47.42 
 
 
279 aa  228  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  54.42 
 
 
265 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  50.64 
 
 
245 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 
260 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 
260 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 
260 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48.65 
 
 
273 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 
260 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 
260 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  50.8 
 
 
257 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 
260 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 
259 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 
260 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
262 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0123  ABC transporter-related protein  49.22 
 
 
259 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897174  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.06 
 
 
272 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.33 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  45.9 
 
 
283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  48.18 
 
 
304 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  49.79 
 
 
272 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  53.95 
 
 
262 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  51.83 
 
 
255 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  48.51 
 
 
289 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  49.41 
 
 
258 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
261 aa  223  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.25 
 
 
259 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.23 
 
 
297 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  48.66 
 
 
264 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  50.93 
 
 
278 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0722  ABC transporter related  50.4 
 
 
269 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.96 
 
 
256 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  53.02 
 
 
262 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  48.05 
 
 
263 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  48.21 
 
 
262 aa  222  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 
261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
308 aa  222  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0096  ABC transporter related  50.39 
 
 
259 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0106  ABC transporter related  50.39 
 
 
259 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0839934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>