More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1494 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1494  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  100 
 
 
299 aa  599  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0815348  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2927  ABC transporter related protein  75.69 
 
 
260 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  62.02 
 
 
269 aa  333  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  57.65 
 
 
266 aa  299  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  57.98 
 
 
265 aa  298  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  56.27 
 
 
290 aa  298  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  59 
 
 
302 aa  292  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  56.81 
 
 
265 aa  291  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  56.86 
 
 
267 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 
271 aa  288  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  54.1 
 
 
286 aa  286  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 
267 aa  285  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  54.15 
 
 
271 aa  285  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  54.15 
 
 
271 aa  285  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  54.15 
 
 
271 aa  285  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  54.15 
 
 
271 aa  285  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  54.15 
 
 
271 aa  285  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  54.15 
 
 
271 aa  285  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  54.15 
 
 
271 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  56.47 
 
 
264 aa  285  7e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 
264 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 
271 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 
264 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  55.29 
 
 
271 aa  281  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 
264 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 
264 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  54.96 
 
 
292 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 
264 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  54.76 
 
 
258 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 
266 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  53.31 
 
 
276 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2691  ABC transporter related protein  58.5 
 
 
271 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5053  ABC transporter related  56.98 
 
 
271 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  55.16 
 
 
283 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  55.86 
 
 
330 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  55.51 
 
 
263 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  54.9 
 
 
275 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  52.45 
 
 
273 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  50.99 
 
 
269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  50.99 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2746  ABC transporter related protein  57.25 
 
 
266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425964  normal  0.919732 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  55.29 
 
 
260 aa  271  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  54.47 
 
 
271 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  54.3 
 
 
303 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  50.39 
 
 
277 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  51.78 
 
 
274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  50.39 
 
 
281 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  48.73 
 
 
273 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3047  ABC transporter related  50.75 
 
 
292 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  50.95 
 
 
285 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  51.11 
 
 
282 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  51.98 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  48.08 
 
 
269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  52.53 
 
 
293 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0358  ABC transporter related protein  55.29 
 
 
267 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  46.1 
 
 
273 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  45.93 
 
 
273 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  53.91 
 
 
271 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  46.1 
 
 
273 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2267  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
270 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  50.79 
 
 
284 aa  262  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  49.43 
 
 
278 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 
273 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  52.92 
 
 
271 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.35 
 
 
273 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
273 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
273 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
273 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
273 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0646  ABC transporter related protein  56.92 
 
 
270 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  50.79 
 
 
274 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  50.97 
 
 
267 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  52.14 
 
 
277 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  49.61 
 
 
264 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
273 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2555  ABC transporter related  53.28 
 
 
269 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.040458  normal  0.702265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  50.2 
 
 
290 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2744  ABC transporter related  53.46 
 
 
269 aa  255  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0180142  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  46.61 
 
 
255 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  52.76 
 
 
284 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4085  ABC transporter related  54.47 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0156292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3465  ABC transporter related protein  54.86 
 
 
277 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  hitchhiker  0.00205843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5111  ABC transporter related protein  54.37 
 
 
262 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  54.47 
 
 
270 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  49 
 
 
268 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  52.53 
 
 
287 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1984  ABC transporter related  49.22 
 
 
271 aa  248  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  47.47 
 
 
267 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  43.57 
 
 
286 aa  248  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  47.01 
 
 
254 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1526  ABC transporter related  46.72 
 
 
283 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  48.21 
 
 
263 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  54.15 
 
 
260 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  49.8 
 
 
625 aa  245  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
257 aa  245  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1628  ABC transporter related  55.51 
 
 
268 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0337589  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0141  iron-siderophore ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 
268 aa  244  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2937  ABC transporter related protein  46.39 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50 
 
 
289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>