More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1484 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  790    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  66.4 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  60.47 
 
 		 389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  41.51 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4069  putative thiolase  43.09 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.655327  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  41.58 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  42.08 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  41.24 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  41.04 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.26 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  41.99 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  40.17 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  39.79 
 
 		 381 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  44.13 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.9 
 
 		 385 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  38.8 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  39.78 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  42.23 
 
 		 393 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  40.55 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  39.52 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  37.8 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  39.59 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  39.02 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  39.9 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  39.9 
 
 		 402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  38.07 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  39.57 
 
 		 386 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.99 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  36.27 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  38.18 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  39.63 
 
 		 390 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  37.87 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  37.2 
 
 		 391 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  36.7 
 
 		 379 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  38.87 
 
 		 390 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  38.36 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  39.47 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  37.3 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  39.74 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  38.93 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  35.64 
 
 		 379 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  39.47 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  39.47 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.23 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  35.68 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  40.82 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  40.16 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  39.89 
 
 		 391 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  39.89 
 
 		 389 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  38.42 
 
 		 385 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  40.53 
 
 		 395 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  35.79 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  35.71 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.53 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  36.7 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  37.6 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.56 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  41.11 
 
 		 388 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  37.17 
 
 		 388 aa  193  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  35.37 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  39.01 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  35.11 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  37.97 
 
 		 389 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  38.27 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.14 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.54 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  38.83 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  45.22 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  37.99 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  39 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.83 
 
 		 397 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  39.39 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  35.87 
 
 		 385 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 		 390 aa  179  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.81 
 
 		 548 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  37.31 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.85 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  41.26 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  34.06 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.91 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.71 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  35.81 
 
 		 548 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  34.55 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  39.94 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  33.24 
 
 		 381 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  35.28 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.88 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  33.95 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  30.89 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.78 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.78 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  31.07 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.75 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  34.39 
 
 		 550 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  34.39 
 
 		 550 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  37.85 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.48 
 
 		 550 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.08 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  31.77 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>