More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1467 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  35.5 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  46.24 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 383 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  32.68 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 287 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  30.99 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35.98 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  40.54 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  28.76 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  27.97 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  30.2 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>