More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1423 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  58.14 
 
 		 300 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  37.15 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 291 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  41.43 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  39.85 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 288 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  35.36 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  35.45 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  38.27 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  39.51 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  34.53 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  36 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 308 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  34.85 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 308 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  31.32 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  34.4 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 306 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 304 aa  106  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  34.14 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  36.78 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  34.1 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 301 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 303 aa  99.4  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.96 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2769  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0236  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 283 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  30.25 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3502  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1873  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0024  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0024  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  34.73 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 297 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 299 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3760  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0176  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 303 aa  92.8  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>