More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1403 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  100 
 
 		 214 aa  417  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.7 
 
 		 232 aa  274  8e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  60.56 
 
 		 213 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.98 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.72 
 
 		 220 aa  224  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.74 
 
 		 239 aa  218  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.09 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.27 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.02 
 
 		 226 aa  214  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.34 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  54.84 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  51.83 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.67 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  56.07 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  50.88 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  53 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  51.17 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.09 
 
 		 210 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.81 
 
 		 225 aa  208  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.05 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.4 
 
 		 215 aa  207  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.42 
 
 		 227 aa  207  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.16 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.53 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.99 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  54.42 
 
 		 218 aa  205  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  53.27 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  53.46 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.44 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.74 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.49 
 
 		 221 aa  204  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.02 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  51.15 
 
 		 219 aa  204  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.69 
 
 		 222 aa  204  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.35 
 
 		 241 aa  203  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.21 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  52.49 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 215 aa  202  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  51.16 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  51.61 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6094  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.68 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634688  normal  0.121163 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.69 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.19 
 
 		 244 aa  201  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.67 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.27 
 
 		 221 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.53 
 
 		 219 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  52.97 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 222 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.69 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  54.93 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.69 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.48 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.99 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.56 
 
 		 224 aa  197  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  49.3 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.89 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  50 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.15 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  49.77 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.15 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3696  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.49 
 
 		 217 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.86 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  51.15 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  47.11 
 
 		 248 aa  194  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.02 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 234 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.07 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  51.39 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.46 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.82 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.66 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  50.7 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  51.85 
 
 		 215 aa  191  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  52.8 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>