112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1400 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1400  endonuclease V  100 
 
 		 231 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0284  Deoxyribonuclease V  61.5 
 
 		 258 aa  254  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33580  Endonuclease V  55.56 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  0.688639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1668  deoxyribonuclease V  56.94 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal  0.261069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2231  Deoxyribonuclease V  54.91 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0289774  hitchhiker  0.00000293854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4157  deoxyribonuclease V  58.73 
 
 		 189 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0737618  decreased coverage  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3356  Deoxyribonuclease V  56.88 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3345  deoxyribonuclease V  53.77 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00000497399  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3777  deoxyribonuclease V  58.29 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3689  endonuclease V  49.07 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46839  normal  0.0492677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1457  Deoxyribonuclease V  59.53 
 
 		 232 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.162733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3899  Deoxyribonuclease V  57.21 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172074  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5432  deoxyribonuclease V  53.92 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0038  Deoxyribonuclease V  51.17 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0625  Deoxyribonuclease V  53.59 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2187  deoxyribonuclease V  49.77 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4912  endonuclease V  41.52 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.710314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3179  endonuclease V  49.77 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3982  Deoxyribonuclease V  50 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6470  Deoxyribonuclease V  44.8 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0671268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0045  endonuclease V  49.05 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13030  endonuclease V  50 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0217  deoxyribonuclease V  47.14 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.438952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6148  Deoxyribonuclease V  42.58 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2758  deoxyribonuclease V  47.6 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0871  Deoxyribonuclease V  43.27 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0602  endonuclease V (deoxyinosine 3'endoduclease)  45.97 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.42515e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0819  endonuclease V  41.43 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000867821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2382  deoxyribonuclease V  47.17 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0299  endonuclease V  40.09 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0299  endonuclease V  40.09 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1932  deoxyribonuclease V  47.14 
 
 		 234 aa  168  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1279  deoxyribonuclease V  46.7 
 
 		 223 aa  167  9e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0152491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0261  deoxyribonuclease V  42.79 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413512  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3591  deoxyribonuclease V  40.87 
 
 		 219 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.515588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2395  deoxyribonuclease V  45.79 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0246  Deoxyribonuclease V  46.45 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.520455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2472  deoxyribonuclease V  44.86 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2695  Deoxyribonuclease V  44.86 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2816  Endonuclease V  45.89 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2526  endonuclease V  43.78 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2924  deoxyribonuclease V  42.73 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0771  endonuclease V  37.38 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.784275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0899  endonuclease V  46.48 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3087  Deoxyribonuclease V  39.01 
 
 		 239 aa  161  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0569  endonuclease V  41.75 
 
 		 221 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000150735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2400  Deoxyribonuclease V  43.46 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0714775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1173  deoxyribonuclease V  39.3 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2425  endonuclease V  47.25 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_508  nfi endonuclease V  38.89 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000219342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4060  Deoxyribonuclease V  38.05 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.145804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3046  Deoxyribonuclease V  44.23 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285667 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0543  endonuclease V  38.71 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265335  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0954  endonuclease V  42.59 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.406571  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1562  deoxyribonuclease V  32.41 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0932  deoxyribonuclease V  37.26 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151025  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1073  endonuclease V  42.13 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.646298  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1197  Deoxyribonuclease V  47.42 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.159778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1151  endonuclease V  40.77 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0954  deoxyribonuclease V  38.21 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000171059  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0258  deoxyribonuclease V  41.98 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0682  deoxyribonuclease V  42 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.718465  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3125  endonuclease V  34.09 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0211  endonuclease V  40.98 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.410173  normal  0.0295932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4501  endonuclease V  39.63 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4499  endonuclease V  39.63 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.105241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4379  endonuclease V  39.63 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.872195 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03875  endonuclease V  39.9 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3996  Deoxyribonuclease V  39.9 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4027  endonuclease V  39.9 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4446  endonuclease V  39.9 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000793274 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4412  endonuclease V  39.63 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4575  endonuclease V  39.63 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.553382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5467  endonuclease V  39.9 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03828  hypothetical protein  39.9 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4232  endonuclease V  39.42 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4541  endonuclease V  39.42 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.905836  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4489  endonuclease V  39.42 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.730874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0460  endonuclease V  39.42 
 
 		 246 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0352  endonuclease V  39.42 
 
 		 246 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3063  deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)  34.63 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3866  endonuclease V  40 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0353  Deoxyribonuclease V  41.18 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3848  endonuclease V  39.42 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0288  endonuclease V  40.66 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.247957  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3712  endonuclease V  40.49 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3033  Deoxyribonuclease V  43.93 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.329103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1980  deoxyribonuclease V  43.54 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0350  deoxyribonuclease V  34.98 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.34523  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0101  Deoxyribonuclease V  29.11 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658544  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0220  endonuclease V  39.51 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0686  endonuclease V  39.23 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.474845 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1244  deoxyribonuclease V  37.8 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0616034  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0224  endonuclease V  40.68 
 
 		 229 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3336  Deoxyribonuclease V  34.7 
 
 		 232 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2984  Deoxyribonuclease V  43.28 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04762  endonuclease V  43.08 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324275  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2108  endonuclease V  39.13 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2338  endonuclease V  40.95 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0237302 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1496  Deoxyribonuclease V  34.07 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>