More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1374 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  73.91 
 
 		 233 aa  295  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  53.1 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  51.34 
 
 		 226 aa  204  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  51.14 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  58.19 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  58.76 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  49.33 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  45.05 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  43.69 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  48.02 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  45.21 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  48.11 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  44.65 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  42.44 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  41.46 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  50.48 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  39.82 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 337 aa  151  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  43.41 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  40.44 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  40.85 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  41.04 
 
 		 231 aa  145  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  41.63 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  42.79 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  45.02 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  43.27 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  37.16 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  40.79 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  42.49 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  38.73 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  34.95 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  34.35 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  37.07 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  37.8 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  37.32 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  40.48 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  33.33 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.96 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  37.84 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  42.54 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  33.01 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  36 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 233 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  35.27 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  31.49 
 
 		 242 aa  99  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  33.81 
 
 		 235 aa  98.6  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 255 aa  98.2  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.8 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  30.74 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  44.07 
 
 		 221 aa  95.5  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.89 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.58 
 
 		 245 aa  94.7  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.22 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  29.61 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  36.26 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  34.5 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  34.11 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  26.84 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.21 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 252 aa  91.7  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  31.46 
 
 		 228 aa  91.7  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  36.7 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  35 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 257 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  33.95 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  37.91 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  34.39 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  33.65 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1596  GntR domain-containing protein  34.55 
 
 		 236 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387143  hitchhiker  0.00000232868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>