More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1353 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  100 
 
 
471 aa  961    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  48.73 
 
 
482 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  47.81 
 
 
491 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  47.18 
 
 
442 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  47.07 
 
 
442 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  45.8 
 
 
438 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  43.92 
 
 
457 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  45.49 
 
 
453 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  45.39 
 
 
457 aa  356  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  42.3 
 
 
486 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  40.44 
 
 
462 aa  336  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  36.93 
 
 
487 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  34.8 
 
 
479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  32.59 
 
 
471 aa  229  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  33.63 
 
 
495 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  32.44 
 
 
472 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  33.03 
 
 
440 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  33.41 
 
 
468 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  36.34 
 
 
491 aa  222  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.92 
 
 
500 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  33.8 
 
 
470 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  35.08 
 
 
466 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  31.91 
 
 
563 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  36.15 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  31.84 
 
 
452 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  30.51 
 
 
467 aa  203  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  30.3 
 
 
558 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  33.13 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  28.84 
 
 
539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  30 
 
 
551 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  34.47 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  31.21 
 
 
497 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  34.1 
 
 
453 aa  199  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.75 
 
 
486 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  30.77 
 
 
536 aa  191  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  31.64 
 
 
523 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.85 
 
 
553 aa  190  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  32.17 
 
 
510 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  31.83 
 
 
488 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  30.74 
 
 
543 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  31.61 
 
 
481 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  32.98 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  28.36 
 
 
571 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  29.67 
 
 
462 aa  182  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  29.66 
 
 
517 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  31.21 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  29.23 
 
 
542 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  30.42 
 
 
490 aa  179  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  30.8 
 
 
484 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  34.64 
 
 
631 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  32.14 
 
 
474 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  28.57 
 
 
480 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  30.34 
 
 
533 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  30.8 
 
 
500 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  28.51 
 
 
548 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  29.65 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  27.92 
 
 
506 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.52 
 
 
638 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  30.93 
 
 
584 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  28.79 
 
 
492 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  29.94 
 
 
480 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  29.07 
 
 
457 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  30.79 
 
 
500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  32.26 
 
 
464 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.24 
 
 
497 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  27.92 
 
 
553 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.4 
 
 
501 aa  163  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  30.51 
 
 
460 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  29.76 
 
 
483 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.93 
 
 
497 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.93 
 
 
497 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.93 
 
 
497 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  31.28 
 
 
459 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.72 
 
 
497 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  27.24 
 
 
559 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  31.36 
 
 
506 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  30.02 
 
 
582 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  32.26 
 
 
556 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  27.87 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  29.1 
 
 
563 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  31.59 
 
 
724 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  28.78 
 
 
470 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  30.89 
 
 
536 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  29.37 
 
 
546 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  30.92 
 
 
560 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  29.87 
 
 
556 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  29.73 
 
 
508 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  29.16 
 
 
542 aa  151  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  29.04 
 
 
637 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  29.04 
 
 
627 aa  149  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  28.32 
 
 
543 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  27.5 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  28.32 
 
 
523 aa  148  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  28.33 
 
 
563 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  27.81 
 
 
555 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  27.75 
 
 
554 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  26.74 
 
 
534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  28.48 
 
 
493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  27.75 
 
 
534 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  30.44 
 
 
536 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>