72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1346 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  420  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  60.43 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  62.44 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  58.01 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  56.83 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  55.85 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  50.54 
 
 		 287 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  54.12 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  53.37 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  55.74 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  53.4 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  48.54 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  49.73 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  54.26 
 
 		 220 aa  154  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  52.22 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  50.23 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  52.48 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  50.29 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  55.43 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  55.43 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  48.96 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  40.19 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  44.27 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  52.81 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  52.81 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  52.81 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  55.49 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2085  hypothetical protein  54.14 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  51.6 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  50.92 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  48.09 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  39.11 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  33.68 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  36.87 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  33.33 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  41.07 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  41.07 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  41.07 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  41.07 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  41.07 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  40 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  40.48 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  39.29 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  29.57 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  30.11 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  27.96 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  28.49 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  27.96 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  27.96 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  28.49 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  28.33 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  26.99 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  27.04 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  26.24 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  26.2 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  25.24 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  24.61 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  30.16 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  25.95 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5653  hypothetical protein  22.35 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5498  hypothetical protein  22.35 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5255  hypothetical protein  22.35 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5196  hypothetical protein  22.35 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0225091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5582  hypothetical protein  22.91 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5084  permease  22.65 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5526  hypothetical protein  22.35 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5425  hypothetical protein  22.35 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0316019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5101  permease  21.79 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5532  hypothetical protein  22.35 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277764  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2664  protein of unknown function DUF161  24.63 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.15293e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1048  hypothetical protein  23.3 
 
 		 215 aa  42  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.864097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>