53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1296 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  330  6e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  37.74 
 
 
168 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  43.48 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  35.77 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  72  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  33.55 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  29.09 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  31.68 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  32.28 
 
 
146 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  35.14 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  29.71 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  27.85 
 
 
181 aa  54.3  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  33.87 
 
 
139 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  33.87 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  34.68 
 
 
134 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  30.22 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  36.5 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  32.67 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  29.05 
 
 
185 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  29.05 
 
 
185 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  29.05 
 
 
185 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  29.63 
 
 
166 aa  47.8  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  31.88 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  29.23 
 
 
187 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  25.93 
 
 
156 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4387  hypothetical protein  27.82 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  29.77 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  32.12 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  32.5 
 
 
138 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  29.32 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  29.32 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  29.32 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  27.05 
 
 
133 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  26.67 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3163  protein of unknown function DUF1486  43.75 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  28.48 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  29.31 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  27.27 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  31.82 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1984  hypothetical protein  32.28 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  32.14 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  32.59 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  25.48 
 
 
358 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  27.5 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  46.03 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  26.52 
 
 
135 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  26.52 
 
 
135 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  30.95 
 
 
156 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4199  hypothetical protein  26.27 
 
 
152 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>