31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1213 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  100 
 
 		 338 aa  681    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  75.88 
 
 		 333 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  71.13 
 
 		 334 aa  431  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  61.14 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  60.3 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  65.38 
 
 		 343 aa  315  6e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  55.15 
 
 		 1001 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  75.94 
 
 		 767 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  58.22 
 
 		 692 aa  296  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  66.52 
 
 		 233 aa  295  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  69.7 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  67.8 
 
 		 494 aa  288  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  48.34 
 
 		 337 aa  275  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  63.76 
 
 		 411 aa  275  8e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  59.69 
 
 		 524 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  57.47 
 
 		 225 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  56.68 
 
 		 221 aa  243  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  54.87 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  56.6 
 
 		 212 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  55.39 
 
 		 356 aa  212  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  53.6 
 
 		 212 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  50.93 
 
 		 1160 aa  210  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  48.71 
 
 		 683 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  46.02 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  60.22 
 
 		 451 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  34.68 
 
 		 221 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  59.52 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  32.53 
 
 		 274 aa  90.9  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  48.39 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0701  UDP-glucose 4-epimerase  25.28 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.399918  normal  0.0107681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  36.73 
 
 		 457 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>