More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1202 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  100 
 
 		 319 aa  646    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  79 
 
 		 317 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.12 
 
 		 302 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.95 
 
 		 298 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  72 
 
 		 287 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.78 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.04 
 
 		 367 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.5 
 
 		 309 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  65.41 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  69.23 
 
 		 315 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.33 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  69.06 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.56 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.86 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.59 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  69.66 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.35 
 
 		 299 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.85 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.21 
 
 		 302 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.75 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  67.27 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  66.06 
 
 		 290 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.79 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.35 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.45 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.9 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  65.78 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.86 
 
 		 290 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.86 
 
 		 290 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.98 
 
 		 279 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.98 
 
 		 298 aa  362  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  62.77 
 
 		 318 aa  358  7e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.17 
 
 		 303 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.55 
 
 		 312 aa  354  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.26 
 
 		 352 aa  339  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.26 
 
 		 279 aa  322  7e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  56.62 
 
 		 279 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.59 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  48.99 
 
 		 249 aa  249  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  47.79 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.34 
 
 		 268 aa  246  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.2 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.81 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  46.22 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.61 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.61 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.61 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  48.61 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.61 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.61 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.61 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.61 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.61 
 
 		 253 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  48.61 
 
 		 253 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  46.55 
 
 		 348 aa  239  5.999999999999999e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  49 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.01 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  50 
 
 		 257 aa  236  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  48.29 
 
 		 268 aa  236  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.41 
 
 		 253 aa  235  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.85 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  49.21 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  46.69 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  47.62 
 
 		 251 aa  233  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  48.81 
 
 		 257 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.82 
 
 		 254 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.88 
 
 		 254 aa  232  8.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  48.62 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  49.41 
 
 		 261 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  47.43 
 
 		 263 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.43 
 
 		 263 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.06 
 
 		 262 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.06 
 
 		 262 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.06 
 
 		 262 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.41 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.24 
 
 		 254 aa  230  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  48.62 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  47.62 
 
 		 262 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  46.72 
 
 		 264 aa  229  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.67 
 
 		 262 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.04 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.22 
 
 		 262 aa  228  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.06 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.06 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  47.84 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  47.06 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.98 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  47.45 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.02 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  46.69 
 
 		 262 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  45.98 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  47.06 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.61 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.43 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  47.06 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.04 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.22 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>