29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1176 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  62.41 
 
 		 128 aa  166  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  58.18 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2022  hypothetical protein  51.69 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12081  hypothetical protein  45.22 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  45.38 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  42.98 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  45.76 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  44.76 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  41.8 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  49.49 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  44.33 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  42.45 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  35.56 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  38.64 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  40.57 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  40.32 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38480  hypothetical protein  38.98 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1243  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.833895  normal  0.479275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  39.18 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  46.39 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0429  hypothetical protein  43.33 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  25.21 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  40.19 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  40.4 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  32.32 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3370  hypothetical protein  38.14 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2546  hypothetical protein  38.14 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  decreased coverage  0.00618755 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  34.41 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>