More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1133 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 
397 aa  811    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  100 
 
 
397 aa  811    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  55.21 
 
 
417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  55.61 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  58.16 
 
 
386 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  54.71 
 
 
429 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  54.57 
 
 
416 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  54.45 
 
 
429 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.08 
 
 
396 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  37.41 
 
 
400 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  39.33 
 
 
402 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  39.02 
 
 
402 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  38.79 
 
 
413 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  38.99 
 
 
402 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  39.02 
 
 
402 aa  259  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  38.5 
 
 
402 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  39.33 
 
 
402 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  38.82 
 
 
402 aa  255  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  38.82 
 
 
402 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  38.82 
 
 
402 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  39.07 
 
 
402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  39.01 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  39.01 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  38.56 
 
 
402 aa  252  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  38.24 
 
 
402 aa  252  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  38.36 
 
 
411 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  39.35 
 
 
387 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  36.88 
 
 
411 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.82 
 
 
396 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  45.84 
 
 
401 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  37.24 
 
 
411 aa  249  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.86 
 
 
403 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.61 
 
 
403 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.35 
 
 
398 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  40.73 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  40.73 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.95 
 
 
403 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  37.44 
 
 
411 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  35.89 
 
 
411 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.81 
 
 
406 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  36.81 
 
 
403 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  36.55 
 
 
403 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  37.47 
 
 
422 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  36.55 
 
 
403 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  38.5 
 
 
408 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  38.24 
 
 
408 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  38.42 
 
 
422 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  35.1 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  46.94 
 
 
517 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.02 
 
 
435 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  36.87 
 
 
348 aa  209  9e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.52 
 
 
431 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  34.36 
 
 
348 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  34.36 
 
 
348 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.29 
 
 
361 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  36.5 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.41 
 
 
406 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.22 
 
 
399 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  36.34 
 
 
399 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  36.05 
 
 
399 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  35.32 
 
 
368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  40.47 
 
 
399 aa  160  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  40.47 
 
 
399 aa  160  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  41.18 
 
 
219 aa  159  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  28.82 
 
 
388 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  38.6 
 
 
231 aa  157  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  30.15 
 
 
376 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  31.78 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  31.68 
 
 
383 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  31.68 
 
 
383 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  31.68 
 
 
383 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  31.68 
 
 
383 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  32.99 
 
 
424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  30.61 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.64 
 
 
376 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  31.03 
 
 
391 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  33.85 
 
 
377 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  28.86 
 
 
440 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  30.1 
 
 
370 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  30.65 
 
 
383 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.57 
 
 
381 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  31.04 
 
 
391 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  29.66 
 
 
383 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  30.71 
 
 
391 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  30.05 
 
 
383 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  29.26 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  29.26 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  29.26 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  30.18 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  29.26 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  30.83 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  32.9 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  29.26 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  31.61 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  29.4 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  31.61 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  28.57 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  32.83 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  31.61 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  31.61 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>