More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1086 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  80.23 
 
 		 180 aa  295  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  62.43 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  55.49 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  58.82 
 
 		 183 aa  198  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  56.14 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  53.22 
 
 		 190 aa  191  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  51.41 
 
 		 194 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  54.07 
 
 		 181 aa  187  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  53.14 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  53.14 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  53.14 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  50.88 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  52 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  50.82 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  50 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  50.29 
 
 		 182 aa  177  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  48.02 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  50.55 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  51.16 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  50.59 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  50 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  47.4 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  48.84 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  49.71 
 
 		 182 aa  168  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  50 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  51.15 
 
 		 182 aa  168  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  44.05 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  47.4 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  45.4 
 
 		 285 aa  165  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  47.43 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  46.82 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  48.55 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  47.62 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  48.8 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  46.99 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  44.05 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  48.5 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  44.17 
 
 		 175 aa  158  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  46.39 
 
 		 183 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  45.03 
 
 		 182 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  44.97 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  46.71 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  46.39 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  47.13 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  44.19 
 
 		 176 aa  150  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  42.44 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  46.29 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  44.91 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  46.07 
 
 		 201 aa  147  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  45.09 
 
 		 195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  44.91 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  45.51 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  39.41 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  44.31 
 
 		 184 aa  144  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  42.26 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  44.79 
 
 		 177 aa  144  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  46.51 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  42.24 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  46.51 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  39.05 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2885  YceI family protein  40.5 
 
 		 229 aa  141  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265419  normal  0.0897618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  44.51 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  40.78 
 
 		 182 aa  140  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  39.8 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  39.88 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  38.55 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  39.64 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  39.16 
 
 		 181 aa  137  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  44.13 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  40.68 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  44.83 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  41.04 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  44.25 
 
 		 201 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  41.28 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  44.83 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  45.51 
 
 		 204 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  43.53 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  41.21 
 
 		 196 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  38.65 
 
 		 195 aa  130  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  42.2 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  42.2 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  41.62 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  37.06 
 
 		 188 aa  127  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  35.12 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  40.45 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  37.95 
 
 		 202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  37.65 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  38.25 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  42.86 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  38.46 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  35.23 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>